同域Bd易感与Bd耐受蛙类皮肤微生物组
该数据集来自 NCBI BioProject（编号 PRJNA1398947），主题为同域分布的 Bd 易感蛙类与 Bd 耐受蛙类的皮肤微生物组，数据以 Raw sequence reads 形式提供
基本信息
资源简介
同域Bd易感与Bd耐受蛙类皮肤微生物组
PRJNA1398947 是 NCBI BioProject 数据库中的一项生物项目记录，主题为同域分布的 Bd 易感蛙类与 Bd 耐受蛙类的皮肤微生物组。该项目以 Raw sequence reads 作为主题标签，意味着其对外提供的数据形式为原始测序读长。BioProject 作为生物数据的集合性记录，通常围绕某一项单一研究计划而建立，来源于单一机构或联合体，并为用户提供统一入口，以便查找该项目所产生的多种类型数据。该数据集在分类上归属于感染性疾病 / 其他，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。整体而言，这一项目聚焦于两栖动物皮肤微生物组与 Bd（蛙类真菌病原）易感性或耐受性之间的关系，通过原始测序数据为相关研究提供基础材料。
【数据集背景】
该项目以同域分布的 Bd 易感蛙类与 Bd 耐受蛙类为研究对象，关注其皮肤微生物组。Bd 通常指引起两栖动物种群衰退的蛙类壶菌病原，而皮肤微生物组被认为是影响宿主对该病原易感性或耐受性的重要因素之一。项目将易感类群与耐受类群置于同一地理区域（同域分布）背景下进行比较，有助于在相近环境条件下考察皮肤微生物群落的差异。该 BioProject 记录本身是围绕这一研究计划组织起来的生物数据集合，来源于单一机构或联合体，旨在为用户提供查找该项目所产生各类数据的统一入口。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Raw sequence reads，表明其核心数据形式是原始测序读长。这些读长应来自对蛙类皮肤微生物组样本的测序，用于后续的微生物群落组成与多样性分析。BioProject 记录本身并不等同于完整的分析结果，而是作为项目层面的索引，链接到该项目生成的不同数据类型。除原始测序读长这一标签外，源站未提供关于具体测序平台、读长长度、样本数量、目标基因或扩增区域等更详细的数据内容说明。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI BioProject 数据库，项目编号为 PRJNA1398947，源站标题为“ID 1398947 - BioProject - NCBI”，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。项目涉及同域分布的 Bd 易感蛙类与 Bd 耐受蛙类的皮肤微生物组。关于具体的采样地点、采样时间、宿主物种名称、样本采集方法、伦理审批信息以及样本处理流程，源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于与两栖动物皮肤微生物组相关的研究场景，尤其是围绕 Bd 易感性与耐受性比较的微生物群落分析。原始测序读长可用于微生物多样性评估、群落结构比较、差异类群识别等下游分析。此外，该 BioProject 记录可作为查找同一研究计划下其他相关数据的入口。由于源站未提供更具体的实验设计与样本信息，实际适用场景需结合项目内其他记录或相关文献进一步确认。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问编号为 PRJNA1398947 的项目记录，并经由该记录获取以 Raw sequence reads 形式提供的数据。BioProject 作为统一入口，通常提供指向不同数据类型的链接，用户可据此定位原始测序读长及相关关联数据。关于具体的下载方式、数据格式、文件组织方式以及配套的分析流程，源站未提供。
【质量与限制】
该记录属于 BioProject 层面的项目索引，提供的是项目级描述与数据链接，而非经过统一质控或标准化处理的分析结果。原始测序读长的质量取决于原始实验与测序过程，源站未提供关于数据质量评估、质控指标、污染控制或批次效应等方面的信息。此外，源站未提供样本量、测序深度、覆盖度等具体指标，因此无法在本描述中对数据质量作出进一步判断。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI BioProject，项目编号为 PRJNA1398947。关于该项目的引用方式、数据使用许可、访问限制或授权条款，源站未提供。用户在使用相关数据时，应参考 NCBI BioProject 记录页面及项目关联信息中可能给出的引用与许可说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1398947
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
两栖动物在全球范围内正在减少，很大程度上是由于壶菌病：一种由真菌病原体Batrachochytrium dendrobatidis (Bd)引起的两栖动物皮肤疾病。对Bd感染的抵抗力和耐受性可表现出种内和种间差异。这种差异除其他因素外，取决于宿主皮肤微生物组。在加利福尼亚州的内华达山脉，濒危的山地黄腿蛙（MYL蛙，Rana sierrae和Rana muscosa）对壶菌病高度易感，而共存的太平洋树蛙（Pseudacris regilla）则较不易感，并可能作为Bd的储存宿主。为了探究皮肤微生物群落的差异是否会导致这些同域宿主的Bd动态变化不同，以及皮肤细菌是否有助于解释P. regilla对Bd的耐受性，我们收集了皮肤拭子，以比较内华达山脉23个地点中MYL蛙和P. regilla的Bd感染情况和宿主皮肤细菌群落。为了初步评估P. regilla是否可能影响现存MYL蛙的Bd动态或皮肤微生物组，我们从单一占据地点和共存地点采样了蛙类。
该数据集包含来自MYL蛙和P. regilla皮肤微生物组的原始序列数据。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
