疑似布鲁氏菌病流产奶牛胎盘液宏基因组数据集
该数据集来自一头发生流产且Rose Bengal Plate Test（RBPT）阳性的奶牛，采集其胎盘液进行宏基因组测序，以刻画其中的微生物群落、识别潜在流产病原并探索与疑似布鲁氏菌感染相关的整体微生物组成
基本信息
资源简介
疑似布鲁氏菌病流产奶牛胎盘液宏基因组数据集
该数据集名为 PRJNA1375750: Metagenomic Characterization of Placental Fluid From an Aborted Cow Suspected of Brucellosis，来源于 ncbi.nlm.nih.gov，在本站归类于感染性疾病 / 其他。数据集的核心材料是一头发生流产的奶牛所采集的胎盘液，该奶牛在 Rose Bengal Plate Test（RBPT）检测中呈阳性。由于 RBPT 是一种针对布鲁氏菌抗体的快速筛查试验，该样本被怀疑与布鲁氏菌病相关。研究者对胎盘液开展宏基因组测序，以刻画其中存在的微生物群落、识别潜在的流产病原，并探索与疑似布鲁氏菌感染相关的整体微生物组成。数据集的主题标签为 Raw sequence reads，即以原始测序读长形式提供数据。
【数据集背景】
本数据集围绕一例奶牛流产病例展开。该奶牛发生流产，并在 Rose Bengal Plate Test（RBPT）中呈阳性结果。RBPT 是一种用于检测布鲁氏菌抗体的快速筛查试验，因此该病例被怀疑与布鲁氏菌病有关。为深入刻画胎盘液中的微生物组成、识别可能导致流产的潜在病原，并探索与疑似布鲁氏菌感染相关的整体微生物群落特征，研究者对采集自该奶牛的胎盘液进行了宏基因组测序，形成了本数据集。
【数据内容】
数据集的主题标签为 Raw sequence reads，表明其内容为宏基因组测序产生的原始序列读长。这些读长来自对胎盘液样本中微生物群落的测序，可用于刻画样本中的微生物组成、识别潜在流产病原，并探索与疑似布鲁氏菌感染相关的整体微生物群落结构。除原始序列读长这一数据类型外，源站未提供关于数据文件数量、文件格式、测序平台、读长长度或数据体积等更具体的信息。
【采集与来源】
样本为胎盘液，采集自一头发生流产且 RBPT 阳性的奶牛。数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov。源站描述说明，该宏基因组数据集正是由这份胎盘液样本产生的，测序目的是刻画其中的微生物群落、识别潜在流产病原并探索与疑似布鲁氏菌感染相关的整体微生物组成。关于采样时间、地点、奶牛品种、饲养管理条件及样本保存方式等信息，源站未提供。
【适用场景】
基于源站描述，该数据集可用于以下方向：刻画流产奶牛胎盘液中的微生物群落组成；识别可能与该流产事件相关的潜在病原；探索在 RBPT 阳性、疑似布鲁氏菌感染背景下胎盘液的整体微生物组成特征。由于数据以原始序列读长形式提供，适合具备宏基因组数据分析能力的研究者用于微生物群落分析与病原探查。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性，源站未提供。
【使用方法】
数据集以 Raw sequence reads 形式提供，使用者需自行对原始测序读长进行后续处理与分析，例如微生物群落组成分析、潜在病原识别等，以回答源站描述中所提出的刻画微生物群落、识别潜在流产病原及探索整体微生物组成等问题。关于具体的分析流程、参数设置、参考数据库选择及推荐工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于单一样本，即一头发生流产且 RBPT 阳性的奶牛的胎盘液，源站描述将其定位为对疑似布鲁氏菌感染相关微生物组成的探索性刻画。RBPT 为快速筛查试验，样本被怀疑与布鲁氏菌病相关，但源站描述未提供确诊结果或其他验证性检测信息。关于测序质量、数据完整性、污染控制及样本代表性等方面的具体指标，源站未提供。
【引用与许可】
关于本数据集的引用方式与使用许可，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1375750
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该宏基因组数据集来源于一头发生流产且玫瑰 Bengal 平板试验（RBPT）呈阳性的奶牛所采集的胎盘液。由于 RBPT 是一种针对布鲁氏菌抗体的快速筛查试验，因此该样本被怀疑与布鲁氏菌病相关。研究进行了宏基因组测序，以表征胎盘液中存在的微生物群落、鉴定潜在的流产病原体，并探索与疑似布鲁氏菌感染相关的整体微生物组成。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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