PRJNA1304582：2022年威斯康星州采集的肩突硬蜱相关微生物群与真菌群数据集
该数据集来自NCBI，包含2022年秋季威斯康星州猎人捕获的白尾鹿体表饱血肩突硬蜱个体样本的细菌（微生物群）和真菌（真菌群）群落数据
基本信息
资源简介
PRJNA1304582：2022年威斯康星州采集的肩突硬蜱相关微生物群与真菌群数据集
PRJNA1304582 是一个来自 NCBI 的原始序列读段数据集，聚焦于肩突硬蜱（Ixodes scapularis）携带的细菌与真菌群落。样本采集自2022年秋季美国威斯康星州猎人捕获的白尾鹿体表饱血蜱，覆盖该州十一个县，饱血蜱在门罗县 Fort McCoy 的称重站从鹿体采集。研究者从单个蜱体提取核酸，分别对 16S rRNA 基因和 ITS2 区域进行高通量测序，以刻画细菌多样性和真菌多样性。数据集提供与各蜱样本对应的原始序列读段，用于支持蜱类微生物群落在自然感染条件下的动态研究。本站将其归入感染性疾病 / 其他分类，主题标签为原始序列读段。
【数据集背景】
蜱类是多种病原体的传播媒介，其体内微生物群与真菌群的组成可能影响病原体定植与传播。肩突硬蜱是北美重要的蜱种，了解其自然状态下携带的微生物群落，有助于认识蜱媒传染病的生态学基础。该数据集正是在这一背景下产生，旨在通过高通量测序手段，对采集自白尾鹿体表的饱血肩突硬蜱个体进行细菌和真菌群落调查，为后续研究蜱微生物动态对自然感染的响应提供原始序列数据。
【数据内容】
数据集的核心内容是单个蜱样本的原始测序读段。细菌群落通过 16S rRNA 基因的高通量测序进行表征，真菌群落则通过 ITS2 区域的高通量测序进行表征。样本以单个蜱为单位处理，每只蜱的核酸提取物分别用于上述两类测序，因此原始读段与个体蜱样本相对应。主题标签为原始序列读段，表明数据以测序读段形式提供，而非经过完整分类注释的丰度表。关于读段数量、文件格式、样本总数等具体细节，源站未提供。
【采集与来源】
样本采集时间为2022年秋季白尾鹿狩猎季，地点为美国威斯康星州。鹿在威斯康星州十一个县范围内被猎取，饱血蜱从鹿体采集，采集工作在门罗县 Fort McCoy 的鹿称重站完成。采集对象为肩突硬蜱的饱血个体。核酸从单个蜱体提取后用于高通量测序。数据来源于 NCBI，项目编号为 PRJNA1304582。关于采集时的具体环境参数、蜱体保存方式及核酸提取试剂等实验细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于蜱类微生物组与真菌组研究，尤其是针对肩突硬蜱自然感染状态下细菌和真菌群落组成的分析。研究者可利用原始读段开展 16S rRNA 基因和 ITS2 区域的生物信息学处理，比较不同个体或不同采集县来源蜱样本的群落差异，探讨微生物群落在自然感染背景下的动态变化。此外，该数据也可作为蜱媒传染病生态学研究的背景数据，用于方法学比较或与其他蜱微生物组数据集的整合分析。关于该数据集是否适用于特定病原体检测或临床诊断，源站未提供。
【使用方法】
使用该数据集时，通常需要对原始序列读段进行质量控制、去噪或聚类、分类注释等标准微生物组分析流程，分别处理 16S rRNA 基因和 ITS2 区域数据。由于数据以单个蜱样本的原始读段形式提供，分析时可按样本标识将读段与个体蜱对应，进而开展群落多样性、组成差异等分析。具体的分析软件、参数设置及参考数据库选择，源站未提供，需使用者根据研究目的自行确定。
【质量与限制】
该数据集基于高通量测序获得原始读段，测序平台、读段长度、测序深度及质量控制指标等具体信息，源站未提供。样本来自2022年秋季威斯康星州十一个县的白尾鹿体表饱血蜱，采集地点和宿主类型相对集中，可能限制结论向其他地区、其他蜱种或其他宿主来源蜱样本的外推。数据仅包含原始序列读段，未提供完整的分类注释结果或统计分析结论。关于样本量、重复数及潜在批次效应等信息，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI，项目编号为 PRJNA1304582。关于数据引用方式、作者列表、发表文献及使用许可条款，源站未提供。使用者在利用该数据集时应遵循 NCBI 的相关数据使用政策，并建议查阅项目页面获取最新的引用与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1304582
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本项目提供了一个数据集，涉及2022年秋季威斯康星州狩猎季期间，从猎人捕获的白尾鹿身上采集的肩突硬蜱（Ixodes scapularis）相关的细菌（微生物群）和真菌（真菌群）群落。这些鹿是在威斯康星州的十一个县内被猎杀的。饱血蜱从威斯康星州门罗县麦考伊堡的鹿称重站收集自鹿体。从单个蜱中提取核酸，并用于16S rRNA基因和ITS2区域的高通量测序，以分别表征细菌和真菌多样性。该数据集提供了与单个蜱样本相关的原始序列读数，以促进对蜱微生物群响应自然感染动态的研究。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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