鼠伤寒沙门菌共感染小鼠分离的PMSS1全基因组测序

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1299134

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目研究小鼠模型中幽门螺杆菌PMSS1株在系统性鼠伤寒沙门菌共感染下的基因组变化。对感染8周后回收的1株对照分离株（HS3-5.2）和3株代表性共感染分离株（HS1-9.1、HS1-10.2、HS1-11.6）进行了全基因组测序。比较分析鉴定出与共感染相关的非同义突变，尤其集中于膜转运相关基因，包括MFS转运蛋白和钴胺素ABC转运蛋白底物结合蛋白。该基因组数据集为理解幽门螺杆菌在多微生物感染过程中的适应策略提供了线索，并突出了具有增强毒力潜力的分离株，可供未来体内致病机制研究使用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。