基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1187611：新冠后损伤表型分析与结局 [Post-CIPO] 研究

PRJNA1187611 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的研究项目记录，其完整名称为“Post-COVID Impairment Phenotyping and Outcomes [Post-CIPO] study”，中文可理解为“新冠感染后损伤表型分型与结局研究”。该数据集在本站被归类为“感染性疾病 / 其他”，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。BioProject 是围绕单一研究计划或倡议而汇集的一组生物数据记录，这些数据通常来自单一机构或联盟。BioProject 记录为用户提供了一个统一入口，用以查找和链接同一项目所生成的不同数据类型。该项目的主题标签为“Raw sequence reads”，即原始序列读长数据。以下将从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

该数据集对应的是 NCBI BioProject 数据库中的一条项目记录，项目编号为 PRJNA1187611，项目名称为“Post-COVID Impairment Phenotyping and Outcomes [Post-CIPO] study”。从名称来看，该项目关注新冠感染后损伤的表型分型与结局，属于感染性疾病相关研究范畴。BioProject 作为生物数据项目的汇总性记录，其设计目的是将同一研究计划下产生的多种类型生物数据集中呈现，方便研究者和公众通过单一入口访问。该项目由单一机构或联盟发起，具体发起方信息源站未提供。项目在本站被归入“感染性疾病 / 其他”分类，表明其与感染性疾病领域相关，但具体细分方向源站未提供。

【数据内容】

该项目的主题标签为“Raw sequence reads”，说明其数据内容涉及原始序列读长。原始序列读长通常指高通量测序平台直接产出的碱基序列片段，是后续拼接、比对和变异分析的基础数据。BioProject 记录本身并不直接存储所有数据文件，而是提供链接以指向该项目生成的不同数据类型。因此，该数据集可能包含与原始序列读长相关的数据入口或关联信息。除原始序列读长外，该项目是否还包含其他类型的数据，源站未提供。项目所涉及的具体样本类型、测序平台、读长长度、数据量等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，即美国国家生物技术信息中心（NCBI）的 BioProject 数据库。BioProject 记录由单一机构或联盟发起，用于汇集同一研究计划产生的生物数据。该项目的具体采集方式、样本来源、采集地点、采集时间、伦理审批信息等，源站未提供。项目名称中提及“Post-COVID”，提示其与新冠感染后状态相关，但具体研究对象、纳入排除标准、随访安排等，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于需要查找或引用与新冠感染后损伤表型分型及结局相关的原始序列读长数据的研究场景。由于 BioProject 提供统一入口链接不同数据类型，研究者可以利用该记录定位到项目所生成的原始序列读长数据，进而开展后续分析，例如序列比对、表达分析、变异检测等。此外，该数据集也可用于感染性疾病领域的二次分析、方法学参考或数据整合研究。具体适用场景取决于原始序列读长的实际内容，而该内容源站未提供。

【使用方法】

使用该数据集时，用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问编号为 PRJNA1187611 的记录页面。该页面提供指向项目所生成的不同数据类型的链接，用户可根据需要跳转至相应的数据资源。由于主题标签为“Raw sequence reads”，用户可能能够获取原始序列读长数据，但具体下载方式、文件格式、访问权限等，源站未提供。用户在使用前应仔细阅读项目页面上的说明和关联链接，以确认数据的具体内容和可用性。

【质量与限制】

该数据集作为 BioProject 记录，其质量取决于项目发起方提交的数据和元数据。BioProject 本身提供统一入口，但不一定对数据质量进行重新评估。该项目的具体质量控制信息、数据完整性、准确性、覆盖度等，源站未提供。此外，项目名称中虽提及“Post-COVID Impairment Phenotyping and Outcomes”，但具体表型定义、结局指标、统计方法等，源站未提供。用户在使用时应结合原始数据及相关文献进行判断。

【引用与许可】

该数据集的引用方式、许可协议、使用限制等信息，源站未提供。用户在引用或使用该数据集时，应访问 NCBI BioProject 记录页面，查看是否有相关的引用指南或使用条款。由于源站未提供具体许可信息，建议用户直接参考 NCBI 的通用政策以及项目页面上的说明。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1187611

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求？千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

去商城查看获取定制方案

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1187611

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本数据集包含作为一项前瞻性队列研究的一部分所采集的唾液和粪便样本的16S rRNA测序图谱，该研究旨在探究与长新冠相关的微生物组变化。该研究从新冠后损伤表型与结局（Post-CIPO）队列中招募了349名成年人。通过自我报告症状的潜在类别分析，参与者被分为三种症状亚表型。微生物组分析揭示了不同症状聚类之间β多样性的显著差异。唾液中的特定分类群，如韦荣球菌属和普雷沃菌属，与咽喉痛相关；而在粪便中，亚细亚颗粒菌属和粪杆菌属与腹部症状呈负相关。这些发现表明，微生物组失调可能与长新冠临床特征相关，且独立于唾液（5.8%）或粪便（1.0%）中病毒RNA的检测。该数据集为微生物组在长新冠中的作用提供了有价值的见解，并支持进一步研究针对微生物组的治疗策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别