日本脑炎病毒感染发生数据集 1935-2015

该数据集收录了1935年至2015年间至少报告过一例有症状人类日本脑炎病毒感染的地点,数据来自多种来源。HealthMap系统自动汇集了2006至2015年的在线警报,经人工核验后纳入800条警报数据;ProMED系统1994年至2007年的报告检索获得135条记录

The University of MelbourneThe University of Melbourne
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文本Disease surveillance
Japanese encephalitis virus infection occurrence dataset 1935-2015

基本信息

模态
文本
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-11-05

资源简介

日本脑炎病毒感染发生数据集 1935-2015

Japanese encephalitis virus infection occurrence dataset 1935-2015

该数据集收录了1935年至2015年间至少报告过一例有症状人类日本脑炎病毒感染的地点,数据来自多种来源。HealthMap系统自动汇集了2006至2015年的在线警报,经人工核验后纳入800条警报数据;ProMED系统1994年至2007年的报告检索获得135条记录。此外还检索了ISI Web of Science和PubMed中的同行评议文献。数据可用于日本脑炎病毒感染的时空分布分析与疾病监测研究(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2024。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):一个记录了1935年至2015年间任何给定年份至少报告过一例有症状人类日本脑炎病毒感染地点的数据库,由多种来源汇编而成。数据由自动化HealthMap系统从在线来源收集。HealthMap警报收集了2006年至2015年的数据,并经过人工有效性核查,最终纳入了来自800条警报的数据。在线传染病报告系统ProMED(Program for Monitoring Emerging Diseases)也从1994年(该程序建立之年)至2007年检索了日本脑炎报告,返回了135条记录。此后假定ProMED报告已被HealthMap系统捕获。为从同行评议文献中收集数据,使用术语“Japanese encephalitis”检索了ISI Web of Science和PubMed截至7月1日的所有记录

【主题与分类】

主题标签:Disease surveillance。本站分类:感染性疾病/其他。

【获取与许可】

源站页面:https://melbourne.figshare.com/articles/dataset/Japanese_encephalitis_virus_infection_occurrence_dataset_1935-2015/25661949/1

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

一个包含1935年至2015年间任何一年至少报告一例有症状人感染日本脑炎病毒地点的数据库,该数据库汇集自多种来源。数据通过自动化HealthMap系统从在线来源整理。HealthMap警报针对2006年至2015年的数据进行了整理,并人工验证其有效性,最终纳入了来自800条警报的数据。在线传染病报告系统ProMED或新发疾病监测计划也从1994年(该计划成立之年)至2007年间搜索了日本脑炎的报道,共返回135条记录。此后,假定ProMED的报道已被HealthMap系统捕获。为了从同行评审文献中整理数据,使用关键词‘日本脑炎’在ISI Web of Science和PubMed中搜索了截至2015年7月1日的所有记录。

对文章摘要进行了审查,并获取了可能包含人类日本脑炎病毒感染地理信息的文章全文(共979篇)。从每篇文章或报告中提取了所有报告的人类日本脑炎病毒感染地点的信息。结合文章或报告中的信息以及谷歌地球、OpenStreetMap和Geonames等在线地名录,为每个报告的感染地点分配了十进制度数的坐标。同一日历年内同一地点(即相同的5×5公里网格方块)报告的多例日本脑炎病例,记录为单次发生。对于面积小于5×5公里的地点(点),仅记录经度和纬度。大于此面积的地点(多边形)则与shapefile关联,其中一、二级行政单位(如省或区)的数据来自联合国粮食及农业组织,三级行政单位的数据来自全球行政区域数据库。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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