基于自顶向下蛋白质组学识别艰难梭菌感染存在与严重程度的粪便宿主生物标志物

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD020117

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

艰难梭菌是成人患者医疗保健相关腹泻的主要原因。艰难梭菌感染（CDI）的实验室诊断具有挑战性，因为尚无单一检测方法能同时兼具高灵敏度和特异性、快速周转时间及成本效益。这些检测方法与临床结局也无相关性或相关性甚微。近年来，基于宿主的检测方法在感染性疾病诊断中表现出令人满意的性能。本研究旨在发现与疾病分期和严重程度相关的CDI特异性宿主生物标志物。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。