trmA对铜绿假单胞菌mRNA表达的影响

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE252633

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

tRNA修饰参与细菌对环境胁迫应答中的基因表达调控。本研究旨在利用Illumina测序技术，比较铜绿假单胞菌PA14菌株中trmA（一种tRNA尿嘧啶-5-甲基转移酶）缺失情况下与野生型的转录谱。trmA的破坏导致基于基因本体生物学过程的许多通路中基因上调和下调。其中一条通路是血红素生物合成，该通路中的基因在trmA突变体中下调。这一发现与trmA突变菌株相比野生型菌株对过氧化氢高度敏感相一致。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。