白色念珠菌RSC复合体组成分化及其调控致病性状作用研究数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE145831

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数据说明

基因表达程序的调控对于微生物病原体在宿主环境中的生存及其致病能力至关重要。本研究探讨了表观遗传调控因子RSC（染色质结构重塑复合物）在最常见的人类真菌病原体白色念珠菌（Candida albicans）中的作用。生化分析表明，CaRSC由13个亚基组成，并包含两个新的非必需成员，我们将其命名为Nri1和Nri2（新型RSC相互作用因子），这两个成员为酵母目CTG进化枝所独有。遗传学分析显示，与模式真菌物种相比，白色念珠菌RSC亚基具有不同的必需性，提示RSC功能在该真菌病原体中存在功能与结构上的分化。对必需催化亚基STH1的条件突变体进行转录组学和蛋白质组学分析，揭示了RSC在白色念珠菌生物学中的全局性作用，大部分生长相关过程受到影响，同时涉及形态转换、宿主-病原体相互作用和适应性适合度的基因也出现调控异常。

我们进一步评估了非必需CaRSC亚基的功能，结果表明新亚基Nri1和含溴结构域亚基Rsc4在菌丝形成和应激反应中发挥作用；二者还在遗传水平上相互作用以调控细胞活力。与上述功能一致，Rsc4为白色念珠菌在小鼠系统性感染模型中实现完全毒力所必需。综上所述，我们的数据构成了首个关于白色念珠菌RSC组成与功能的综合性研究，揭示了其与模式真菌系统相比既有保守特征又有独特特征，并阐明了白色念珠菌如何利用RSC依赖的转录调控来响应环境信号并驱动其在哺乳动物中的适应性和毒力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。