小鼠模型朊病毒感染综合转录谱数据
该数据集来自ebi.ac.uk，包含对感染三种小鼠适应痒病株的两株不同小鼠脑组织进行cDNA微阵列分析所得的基因表达数据
基本信息
资源简介
小鼠模型朊病毒感染综合转录谱数据
Comprehensive transcriptional profiling of prion infection in mouse models reveals networks of responsive genes.
该数据集来自ebi.ac.uk，包含对感染三种小鼠适应痒病株的两株不同小鼠脑组织进行cDNA微阵列分析所得的基因表达数据。研究通过广泛收集和分析数据，识别出349个在小鼠模型中表达持续改变的朊病毒相关基因（PRGs），并利用基因本体分析将许多上调基因归入与主要神经病理相关的功能组。数据可用于研究朊病毒感染后中枢神经系统进行性神经退行性变背后的分子事件，以及筛选核心响应基因网络（来源 BioStudies）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：朊病毒感染导致中枢神经系统进行性神经退行性变，并不可避免地导致死亡。朊病毒病在大脑中的病理效应在形态学上已有明确定义，如胶质增生、空泡化和疾病特异性蛋白酶抗性朊病毒蛋白（PrPSc）的积累。然而，导致神经元死亡的潜在分子事件尚不清楚。本研究使用cDNA微阵列对感染三种小鼠适应痒病株的两株不同小鼠品系的大脑基因表达变化进行了分析。收集并分析了大量数据，从中鉴定出一组由349个朊病毒相关基因（PRGs）组成的核心基因群，这些基因在小鼠模型中一致显示表达改变。基因本体分析将许多上调基因归入与主要神经病理相关的功能组之一。
【主题与分类】
主题标签：unknown experiment type、Mus musculus。本站分类：感染性疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-10310
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- OpenDataLab:
数据说明
stephanie booth; Stephanie Booth (2010). Comprehensive transcriptional profiling of prion infection in mouse models reveals networks of responsive genes. [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-10310
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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