马达加斯加蝙蝠Morbilli相关副黏病毒感染的生态流行病学研究数据
在马达加斯加蝙蝠群落中开展了一项生态流行病学调查,以更好地理解影响蝙蝠种间病毒传播的进化机制和环境因素,这些蝙蝠属于Morbillivirus属中密切相关的成员,目前称为Unclassified Morbilli-related paramyxoviruses(UMRVs)

基本信息
资源简介
马达加斯加蝙蝠Morbilli相关副黏病毒感染的生态流行病学研究数据
在马达加斯加蝙蝠群落中开展了一项生态流行病学调查,以更好地理解影响蝙蝠种间病毒传播的进化机制和环境因素,这些蝙蝠属于Morbillivirus属中密切相关的成员,目前称为Unclassified Morbilli-related paramyxoviruses(UMRVs)
Data from: An eco-epidemiological study of Morbilli-related paramyxovirus infection in Madagascar bats reveals host-switching as the dominant macro-evolutionary mechanism
【数据集背景】
源站首次发布:2017。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):在马达加斯加蝙蝠群落中开展了一项生态流行病学调查,以更好地理解影响蝙蝠种间病毒传播的进化机制和环境因素,这些蝙蝠属于Morbillivirus属中密切相关的成员,目前称为Unclassified Morbilli-related paramyxoviruses(UMRVs)。共调查了947只蝙蝠,来自52个捕获点(22个洞穴、18个建筑和12个户外点),分布于该岛不同的生物气候区。使用靶向Paramyxoviridae科L聚合酶基因的RT-PCR,我们发现10.5%的采样蝙蝠被感染,涉及7个科中的6个科和31个分析物种中的15个。单变量分析表明,非生物和生物因素均可能促进病毒感染。使用叠加在生物和非生物因素上的UMRV感染广义线性模型
【主题与分类】
主题标签:感染性疾病、蝙蝠、副黏病毒、Morbillivirus、生态流行病学、宿主转换、RT-PCR、马达加斯加。本站分类:感染性疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.06g12
使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。
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- OpenDataLab:
数据集大小约 480.8 KB。
数据说明
在马达加斯加蝙蝠群落中开展了一项生态流行病学调查,以更好地理解影响蝙蝠物种间病毒传播的进化机制和环境因素,这些病毒属于麻疹病毒属中亲缘关系较近的成员,目前被称为未分类麻疹相关副黏病毒(UMRVs)。共调查了947只蝙蝠,来源于52个捕获地点(22个洞穴、18座建筑物和12个户外地点),分布于该岛不同的生物气候带。利用针对副黏病毒科L聚合酶基因的RT-PCR,我们发现10.5%的采样蝙蝠被感染,涉及7个科中的6个科以及所分析的31个物种中的15个物种。单变量分析表明,非生物和生物因素均可能促进病毒感染。使用广义线性模型对UMRVs感染与生物和非生物变量进行叠加分析,我们证明蝙蝠的同域共存是病毒传播的主要因素。系统发育分析显示,感染马达加斯加蝙蝠的所有副黏病毒均为UMRVs,且宿主特异性很低。
使用最大简约性协调工具CoRe-PA进行的分析表明,在马尔加什蝙蝠中,宿主转换而非共物种形成是UMRV的主要宏观进化机制。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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