两栖动物物种特征、进化历史与环境预测蛙壶菌感染模式而非灭绝风险的数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.t54h6

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数据集大小约 762.3 KB。

数据说明

真菌病原体蛙壶菌(Batrachochytrium dendrobatidis, Bd)已成为两栖动物灭绝的主要因素，需要对许多易感物种采取保护干预措施。识别易感物种具有挑战性，但预测物种生物学的许多方面会影响宿主对疾病的抗性、耐受性或回避策略的演化。反过来，我们可能预期表现出这些不同策略的物种在存活于流行病爆发方面的能力存在差异。在此，我们通过汇编涵盖95个地点的Bd感染调查全球数据集，检验了302种两栖动物中Bd感染风险和感染强度的系统发育及基于性状的模式。然后，我们使用将性状、分类学和环境与Bd感染风险和强度相关联的最佳拟合模型，预测了122种经历过Bd流行病爆发的新热带两栖动物的宿主疾病缓解策略（耐受、抗性、回避），并记录了这些事件中物种的存续或灭绝情况。

两栖动物物种的生活史、栖息地利用和气候生态位等方面，与世界各地区Bd感染模式的变异始终相关联。然而，基于地点环境和物种特征预测的Bd感染风险及强度，并未在预测的宿主疾病缓解策略与灭绝结果之间揭示出一致模式。这表明，无论是耐受型还是抗性型物种，在疾病流行事件中可能都不具有缓解疾病的优势，或者有其他因素驱动了两栖动物种群在壶菌病暴发期间的存续。这些结果表明，采用基于特征的方法或许能让我们识别出对地方性Bd感染具有抗性或耐受性的物种，但该方法可能不足以最终识别出因疾病流行而面临灭绝风险的物种。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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