前垂体功能缺陷伴可变免疫缺陷的基因-疾病关联
该数据集来自 Frontiers in Figshare，包含一份 Excel 表格，对应一项关于原发性免疫缺陷相关基因与水痘-带状疱疹病毒再激活综合征之间因果关系的孟德尔随机化研究
基本信息
资源简介
前垂体功能缺陷伴可变免疫缺陷的基因-疾病关联
Table1_Primary immunodeficiency-related genes and varicella-zoster virus reactivation syndrome: a Mendelian randomization study.xlsx
该数据集来自 Frontiers in Figshare，包含一份 Excel 表格，对应一项关于原发性免疫缺陷相关基因与水痘-带状疱疹病毒再激活综合征之间因果关系的孟德尔随机化研究。研究选取 110 个单核苷酸多态性作为工具变量，遗传关联数据来自全基因组关联研究，结局数据取自 GWAS Catalog 和 FINNGEN 数据库，主要采用逆方差加权和敏感性分析。数据可用于探索免疫缺陷相关基因与病毒再激活综合征的因果关联（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《The Spectrum of Neurological Manifestations of Varicella–Zoster Virus Reactivation》发表于 Viruses（2023），DOI：10.3390/v15081663。源站首次发布：2024-08-26。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：背景目前，关于原发性免疫缺陷相关基因与水痘-带状疱疹病毒再激活综合征之间因果关系的证据有限且不一致。因此，本研究采用孟德尔随机化（MR）方法探讨两者之间的因果关系。方法本研究选取 110 个原发性免疫缺陷相关基因的单核苷酸多态性（SNPs）作为工具变量（IVs）。原发性免疫缺陷相关基因的遗传关联数据来自近期关于人血浆蛋白水平和循环免疫细胞的全基因组关联研究（GWAS）数据。与水痘-带状疱疹病毒再激活综合征相关的基因数据来自 GWAS Catalog 和 FINNGEN 数据库，主要采用逆方差加权（IVW）和敏感性分析进行分析。结果通过 MR 分析，w
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 122.36 KB。数据集 DOI：10.3389/fimmu.2024.1403429.s001。
【主题与分类】
源站学科分类：Transplantation Immunology、Tumour Immunology、Immunology not elsewhere classified、Immunology、Veterinary Immunology、Animal Immunology。主题标签：primary immunodeficiency-related genes、neurological complications、Mendelian randomization、two-sample study。本站分类：感染性疾病/其他。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Transplantation Immunology、Tumour Immunology、Immunology not elsewhere classified、Immunology、Veterinary Immunology、Animal Immunology。
【获取与许可】
源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table1_Primary_immunodeficiency-related_genes_and_varicella-zoster_virus_reactivation_syndrome_a_Mendelian_randomization_study_xlsx/26829358
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Wang, Hao; Chen, Guanglei; Gong, Qian; Wu, Jing; Chen, Peng (2024). Table1_Primary immunodeficiency-related genes and varicella-zoster virus reactivation syndrome: a Mendelian randomization study.xlsx. Frontiers. Dataset
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数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Table1_Primary immunodeficiency-related genes and varicella-zoster virus reactivation syndrome: a Mendelian randomization study.xlsx
- DOI：10.3389/fimmu.2024.1403429.s001
- 发布日期：2024-08-26
- 文件数：1 个
- 文件总体积：122.36 KB
- 源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table1_Primary_immunodeficiency-related_genes_and_varicella-zoster_virus_reactivation_syndrome_a_Mendelian_randomization_study_xlsx/26829358
命令行下载
curl -L -o "Table1_Primary immunodeficiency-related genes and varicella-zoster virus reactivation syndrome: a Mendelian randomization study.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/48776188"
文件清单
Table1_Primary immunodeficiency-related genes and varicella-zoster virus reactivation syndrome: a Mendelian randomization study.xlsx（122.36 KB）
文件总体积 122.36 KB（源站 API 实测）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
背景目前，关于原发性免疫缺陷相关基因与水痘-带状疱疹病毒再激活综合征之间因果关系的证据有限且不一致。因此，本研究采用孟德尔随机化（MR）方法探讨两者之间的因果关系。方法本研究选取110个原发性免疫缺陷相关基因的单核苷酸多态性（SNPs）作为工具变量（IVs）。原发性免疫缺陷相关基因的遗传关联数据来源于近期关于人血浆蛋白水平和循环免疫细胞的全基因组关联研究（GWAS）数据。与水痘-带状疱疹病毒再激活综合征相关基因的数据来自GWAS Catalog和FINNGEN数据库，主要采用逆方差加权法（IVW）和敏感性分析进行分析。
结果：通过孟德尔随机化分析，我们识别出9个与带状疱疹及其后续神经痛存在因果关联的原发性免疫缺陷相关基因；确定了20个原发性免疫缺陷相关基因与三种血管病变（卒中、脑动脉瘤、巨细胞动脉炎）的因果关联；揭示了10个原发性免疫缺陷相关基因与两种眼部疾病（视网膜病变、角膜炎）的因果关联；此外，分别有3个原发性免疫缺陷相关基因与脑炎、颅神经麻痹及胃肠道感染相关。结论：本研究发现原发性免疫缺陷相关基因与水痘-带状疱疹病毒再激活综合征之间存在一定关联，但仍需进一步研究以探索这些关联的具体机制。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.3389/fimmu.2024.1403429.s001（source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table1_Primary_immunodeficiency-related_genes_and_varicella-zoster_virus_reactivation_syndrome_a_Mendelian_randomization_study_xlsx/26829358）。
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