中性粒细胞胞外诱捕网通过NCF2依赖性信号驱动骨质疏松症：整合转录组学与机制验证
该数据集是一个整合转录组学与实验验证的医学研究数据集，包含大鼠骨质疏松模型中的RNA-seq转录组数据、中性粒细胞胞外诱捕网（NETs）标志物检测数据、关键基因（如NCF2）的敲低实验数据以及药物预测分析结果，数据模态涉及基因表达文本、细胞实验和临床病理信息，主要用于揭示NETs通过NCF2依赖性信号通路驱动骨质疏松的免疫机制，为骨质疏松症的靶向治疗提供新的研究方向和潜在生物标志物。
基本信息
资源简介
中性粒细胞胞外诱捕网通过NCF2依赖性信号驱动骨质疏松症：整合转录组学与机制验证
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Neutrophil extracellular traps drive osteoporosis via NCF2-dependent signaling: integrated transcriptomics with mechanistic validation》。配套论文《Neutrophil extracellular traps drive osteoporosis via NCF2-dependent signaling: integrated transcriptomics with mechanistic validation》发表于 Redox Report（2025），DOI：10.1080/13510002.2025.2534745。项目资助方：The present study was supported by the National Natural Science Foundation of China (grant number 82205140); the Basic Research Program of Jiangsu Province (Natural Science Foundation, grant number BK20220468); the Young Talent Lifting Project of the Chinese Society of Traditional Chinese Medicine (CACM-2022-QNRC2-B28); the Foundation of Jiangsu CM Clinical Innovation Centre of Degenerative Bone & Joint Disease [Jiangsu Science and Education of Traditional Chinese Medicine (2021-No. 4)]; the Scientific and Technological Innovation Project of the China Academy of Chinese Medical Sciences (grant number CI2024D003); the Key Laboratory of Xin’an Medicine (Anhui University of Chinese Medicine) (grant number 2024xyx03); and the project of Capital Clinical Characteristic Diagnosis and Treatment Technology Research and Translational Application (grant number Z221100007422074).。源站首次发布：2025-07-23。
【数据内容】
源站原始描述：Inflammation and immune responses play key roles in osteoporosis (OP) pathogenesis. Osteoimmunology highlights immune dysregulation as a significant contributor to OP, but the specific biological mechanisms linking immune dysfunction to bone loss remain unclear. Understanding these mechanisms is essential for targeted therapies. We established a rat OP model via bilateral ovariectomy. Transcriptomic sequencing (RNA-seq) identified differentially expressed genes (DEGs), and summary data-based Men…
【数据结构与技术规格】
文件数 6 个，合计 2.34 MB。Fig S2.docx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document，881.87 KB。FigS1.docx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document，673.14 KB。Table S1.docx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document，735.55 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.29623565.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Biophysics、Cell Biology、Molecular Biology、Physiology、Immunology、Biological Sciences not elsewhere classified。主题标签：Osteoporosis、immunoporosis、NETs formation、drug targets、Mendelian randomization。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biophysics、Cell Biology、Molecular Biology、Physiology、Immunology、Biological Sciences not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Neutrophil_extracellular_traps_drive_osteoporosis_via_NCF2-dependent_signaling_integrated_transcriptomics_with_mechanistic_validation/29623565
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Neutrophil extracellular traps drive osteoporosis via NCF2-dependent signaling: integrated transcriptomics with mechanistic validation. Taylor & Francis. Guo, Xiangyun; Wang, Liang; Chen, Shuangliu; Sun, Chuanrui; Qin, Jinran; Liu, Qingqing; et al
【使用注意】
· 源站最后修改于 2025-12-08，引用时请注意版本时效。
下载信息
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暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取（Figshare）
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集旨在研究免疫炎症在骨质疏松症（OP）发病机制中的作用，特别是中性粒细胞胞外诱捕网（NETs）与骨丢失之间的关联。数据集通过构建大鼠双侧卵巢切除骨质疏松模型，结合转录组测序（RNA-seq）和基于汇总数据的孟德尔随机化（SMR）分析，识别差异表达基因（DEGs）并验证其与OP的因果关系。数据内容包括大鼠骨组织的RNA-seq数据、NETs标志物（NE、MPO、CitH3）的检测结果、关键基因（VDAC1、PLCG2、NCF2）的实验验证数据，以及通过siRNA敲低NCF2对NETs形成和成骨细胞分化的影响分析。此外，数据集还包含药物预测和分子对接分析结果。该数据集主要应用于骨质疏松症的免疫机制研究、靶向治疗探索，以及骨代谢相关生物标志物的发现。
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