基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1305174：6-姜酚改善艰难梭菌相关性腹泻小鼠模型肠道菌群

PRJNA1305174 是一个来自 NCBI BioProject 的公开数据集，其英文名称为“6-Gingerol improves gut microbiota in a mouse model of Clostridium difficile-associated diarrhea”。该数据集围绕 6-姜酚对艰难梭菌相关性腹泻小鼠模型肠道菌群的改善作用展开，主题标签为“Raw sequence reads”，表明其核心数据形式为原始序列读长。数据集在分类上归属于感染领域下的艰难梭菌感染方向，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。作为 BioProject 体系中的一项记录，它汇集了与这一研究计划相关的多种数据类型，为用户提供了统一入口以定位和访问该项目所产生的数据。整体而言，该数据集服务于探索 6-姜酚干预与艰难梭菌相关性腹泻小鼠肠道菌群变化之间关系的科研需求，适合对感染微生态、天然产物干预及测序数据分析感兴趣的研究人员关注与使用。

【数据集背景】

艰难梭菌感染是感染领域的重要议题，而艰难梭菌相关性腹泻则是其常见临床表现。该数据集所对应的研究计划聚焦于小鼠模型，考察 6-姜酚对肠道菌群的改善作用。这一主题将天然产物干预与感染性腹泻的微生态调节联系起来，属于感染与肠道微生物交叉的研究方向。数据集以 BioProject 形式组织，其背景信息依托 NCBI 对 BioProject 的通用定义：BioProject 是围绕单一研究计划、来自单一组织或联盟的生物学数据集合，并为用户提供查找该项目所产生各类数据的统一位置。该数据集在分类上被归入“感染 / 艰难梭菌感染”，主题标签为“Raw sequence reads”，说明其数据主体是测序产生的原始读长，而非经过高度加工的分析结果。对于希望了解 6-姜酚如何影响艰难梭菌相关性腹泻模型肠道菌群的研究者而言，该数据集提供了一个可追溯、可定位的数据资源入口。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，表明其数据内容以原始序列读长为核心。数据集英文名称明确指向“6-Gingerol improves gut microbiota in a mouse model of Clostridium difficile-associated diarrhea”，即 6-姜酚改善艰难梭菌相关性腹泻小鼠模型肠道菌群。由此可知，数据内容与小鼠肠道菌群测序相关，并服务于 6-姜酚干预效果的研究。作为 BioProject 记录，它并不局限于单一数据类型，而是提供指向该项目所生成多种数据类型的链接。不过，关于具体的样本数量、测序平台、读长长度、数据量大小、分析流程等细节，源站未提供。因此，在数据内容层面，可以确认的是其原始序列读长属性以及与肠道菌群研究相关的主题，但更细颗粒度的数据构成信息无法从现有信息中获知。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“BioProject - NCBI”。其英文名称中包含 PRJNA1305174 这一编号，表明它是 NCBI BioProject 体系中的一项记录。根据源站描述，BioProject 是围绕单一研究计划、来自单一组织或联盟的生物学数据集合，BioProject 记录为用户提供查找该项目所产生各类数据的统一位置。该数据集在来源上属于 NCBI BioProject，主题标签为“Raw sequence reads”，分类为“感染 / 艰难梭菌感染”。关于具体的样本采集地点、采集时间、实验动物品系、干预剂量、测序机构等采集细节，源站未提供。因此，在采集与来源方面，可以确认的是其 NCBI BioProject 归属及编号，但更具体的采集背景信息无法从现有信息中获知。

【适用场景】

该数据集适用于与艰难梭菌感染、艰难梭菌相关性腹泻、肠道菌群以及 6-姜酚干预相关的研究场景。由于主题标签为“Raw sequence reads”，它可用于需要原始测序读长的分析工作，例如肠道菌群组成分析、差异丰度分析或更广泛的微生物组数据再分析。该数据集也可作为 BioProject 记录，用于查找和链接同一研究计划下的多种数据类型。对于关注天然产物改善感染相关肠道微生态的研究者，该数据集提供了与小鼠模型相关的原始序列数据入口。此外，在感染 / 艰难梭菌感染分类下，它可服务于感染微生态、益生元或天然产物干预等方向的探索。关于具体的适用分析流程、推荐工具或预期结论，源站未提供。

【使用方法】

该数据集来自 NCBI BioProject，编号为 PRJNA1305174，用户可通过 NCBI 网站访问该 BioProject 记录，并借助其提供的链接查找该项目所生成的各类数据。由于主题标签为“Raw sequence reads”，使用者可预期获取原始序列读长数据，并在此基础上开展后续分析。BioProject 记录的设计目的即在于为用户提供单一入口，以定位与同一研究计划相关的多样数据类型。因此，使用方法上可先访问该 BioProject 记录，再根据记录中的链接跳转至具体数据资源。关于具体的下载方式、数据格式、分析软件、参数设置等操作细节，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 NCBI BioProject 记录，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“BioProject - NCBI”。其主题标签为“Raw sequence reads”，分类为“感染 / 艰难梭菌感染”。关于数据质量指标、测序深度、覆盖度、错误率、批次效应、样本量、对照设置等质量相关信息，源站未提供。限制方面，由于源站未提供具体的数据构成、采集细节和分析流程，使用者在使用该数据集时需注意其原始序列读长属性，并应结合 BioProject 记录中的链接进一步核实可用数据。关于该数据集是否存在特定偏倚、是否经过同行评审、是否有配套论文等，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来自 NCBI BioProject，编号为 PRJNA1305174，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款、是否允许再分发或商业使用等信息，源站未提供。使用者应访问该 BioProject 记录页面，以获取与引用和许可相关的官方说明。由于源站未提供具体引用格式或许可类型，此处无法给出进一步的引用建议或授权说明。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1305174

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1305174

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目考察了6-姜酚（生姜中的主要生物活性化合物）对艰难梭菌相关性腹泻（CDAD）小鼠模型肠道微生物群的影响。收集对照组和治疗组的粪便样本，并进行了16S rRNA基因测序，以分析6-姜酚干预后微生物多样性和组成的变化。该数据集为6-姜酚在CDAD期间对肠道微生物群的调节作用提供了证据，并支持针对该病症的微生物群靶向疗法的进一步研究。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别