Omenn综合征患者与健康对照PBMC分选CD3+/CD19+及CD3-CD19-的scRNA-seq

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-12283

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在本研究中，我们旨在通过研究典型Omenn综合征或T-B- SCID患者，拓展对淋巴细胞发育的认识。为了进一步深入了解病理机制，我们对来自Omenn综合征患者（这些患者分别与NUDCD3变异（3名患者/3份样本）、RAG1致病缺陷（6名患者/6份样本）或RAG2致病缺陷（2名患者/2份样本）相关）以及健康对照（2份样本）的冷冻保存外周血单个核细胞进行了单细胞研究，以作比较。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。