过敏性肺炎血浆蛋白组数据
过敏性肺炎血浆蛋白组数据 与肺炎(Pneumonitis)高度相关,包含表格形式的样本、标注、临床变量、组学记录或权威知识条目,可用于疾病分类、特征筛选、模型训练和公开数据集整理。

基本信息
资源简介
过敏性肺炎血浆蛋白组数据
【一句话概览】
研究纳入2018年7月至2022年6月中国间质性肺病国家队列和PORTRAY IPF队列的119名受试者,包括32名健康对照、31名非纤维化过敏性肺炎、28名纤维化过敏性肺炎和28名特发性肺纤维化患者。血浆样本经定量蛋白质组学分析,共鉴定813种蛋白,其中493种可靠定量。通路分析提示氮代谢、酒精成瘾信号和甲状腺激素生物合成参与发病。基于机器学习的蛋白质组模型用于区分过敏性肺炎亚型与特发性肺纤维化,支持向量机在独立测试集表现最稳健均衡,准确率71.4%,敏感性与特异性相等(来源 ProteomeXchange)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Plasma Proteomics and Machine Learning Deliver Non-invasive Distinction between Fibrotic Hypersensitivity Pneumonitis and Idiopathic Pulmonary Fibrosis》。
【数据内容】
源站原始描述:A total of 119 subjects were enrolled from the Chinese Interstitial Lung Disease (ILD) National Cohort and the PORTRAY IPF Cohort between July 2018 and June 2022, including 32 healthy controls (HCs), 31 non-fibrotic HP (NFHP), 28 FHP, and 28 IPF cases. Plasma samples underwent quantitative proteomic profiling, weighted gene co-expression network analysis (WGCNA), and bioinformatics analysis to identify differentially expressed proteins, core pathways, and co-expression modules. Key proteins were…
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):2018年7月至2022年6月期间,从中国间质性肺疾病(ILD)国家队列和PORTRAY IPF队列中共纳入119名受试者,包括32名健康对照(HCs)、31名非纤维化性过敏性肺炎(NFHP)、28名纤维化性过敏性肺炎(FHP)和28名特发性肺纤维化(IPF)病例。对血浆样本进行了定量蛋白质组学分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)及生物信息学分析,以识别差异表达蛋白、核心通路和共表达模块。选取关键蛋白,运用机器学习算法构建并验证疾病鉴别模型。蛋白质组数据集包含813个鉴定出的蛋白质,其中493个被可靠定量。通路分析提示氮代谢、酒精成瘾信号传导及甲状腺激素生物合成参与疾病发病机制。开发了一种基于机器学习的蛋白质组学模型,用于区分过敏性肺炎亚型与IPF。支持向量机(SVM)算法在独立测试集上展现出最为稳健且均衡的性能,准确率达到71.4%,敏感性和特异性相等。该模型为初步病例鉴别提供了一种非侵入性工具,并为纤维化肺疾病的精准医疗提示了潜在的生物标志物。
【数据结构与技术规格】
文件数 60 个。
【主题与分类】
主题标签:Homo sapiens、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://proteomecentral.proteomexchange.org/dataset/PXD069424
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://proteomecentral.proteomexchange.org/cgi/GetDataset?ID=PXD069424
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
过敏性肺炎血浆蛋白组数据 是与肺炎相关的公开表格数据资源,提供疾病样本、标注、变异、表达谱或标准化知识,主要用于分类和医学数据整理。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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