免疫与自身免疫疾病靶点(TNF、IL6、JAK1、MMP9、FOXP3、HLA-DRB1)精修坐标结构与口袋分析数据集

本数据集面向免疫与自身免疫疾病靶点,涵盖 TNF、IL6、JAK1、MMP9、FOXP3、HLA-DRB1,提供精修后的坐标结构与口袋分析结果

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Refined Coordinate Structures and Pocket Analyses for Immunology and Autoimmune Disease Targets (TNF, IL6, JAK1, MMP9, FOXP3, HLA-DRB1)

基本信息

模态
其他
大小
0.000384752 GB
任务类型
预测
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-13
版本
v1.1-nrc-restored

资源简介

免疫与自身免疫疾病靶点(TNF、IL6、JAK1、MMP9、FOXP3、HLA-DRB1)精修坐标结构与口袋分析数据集

Refined Coordinate Structures and Pocket Analyses for Immunology and Autoimmune Disease Targets (TNF, IL6, JAK1, MMP9, FOXP3, HLA-DRB1)

本数据集面向免疫与自身免疫疾病靶点,涵盖 TNF、IL6、JAK1、MMP9、FOXP3、HLA-DRB1,提供精修后的坐标结构与口袋分析结果。源站描述给出各靶点的构象稳定性(ESMFold-V2 的 pLDDT)、药代动力学预测(BioNeMo 的 LogD、结合亲和力、预测半衰期)与就绪评分,并说明坐标与分析带有 CRC32/MD5 可校验清单。数据可用于靶点结构评估、结合口袋分析与成药性相关预测研究,采用 CC BY 4.0 许可开放学术使用(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):临床治疗规范:第5批:免疫与自身免疫疾病 标准:符合GLP / 制药级 靶点:TNF 构象稳定性(ESMFold-V2) - pLDDT:87.2 药代动力学(BioNeMo) - LogD:1.95 - 结合亲和力:高 - 预测半衰期:12.0小时 - 就绪评分:0.93 靶点:IL6 构象稳定性(ESMFold-V2) - pLDDT:89.5 药代动力学(BioNeMo) - LogD:1.95 - 结合亲和力:高 - 预测半衰期:12.0小时 - 就绪评分:0.93 靶点:JAK1 构象稳定性(ESMFold-V2) - pLDDT:92.1 药代动力学(BioNeMo) - LogD:1.95 - 结合亲和力:高 - 预测半衰期:24.5小时 - 就绪评分:0.93 完整性与来源:坐标与分析带有CRC32/MD5可校验清单;TTT-7审计标记仅为组织约定。许可:CC BY 4.0 — 开放供学术

【主题与分类】

主题标签:ACE2、BY、CC、CFTR、CRC32、DMD、DPP4、DRB1、F8、F9。本站分类:免疫系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.22994451

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 384.8 KB。

数据说明

临床治疗规范:第5批:免疫学与自身免疫性疾病 标准:GLP对齐 / 制药级 ## 靶点:TNF ### 构象稳定性(ESMFold-V2) - pLDDT:87.2 ### 药代动力学(BioNeMo) - LogD:1.95 - 结合亲和力:高 - 预测半衰期:12.0小时 - 就绪评分:0.93 ## 靶点:IL6 ### 构象稳定性(ESMFold-V2) - pLDDT:89.5 ### 药代动力学(BioNeMo) - LogD:1.95 - 结合亲和力:高 - 预测半衰期:12.0小时 - 就绪评分:0.93 ## 靶点:JAK1 ### 构象稳定性(ESMFold-V2) - pLDDT:92.1 ### 药代动力学(BioNeMo) - LogD:1.95 - 结合亲和力:高 - 预测半衰期:24.5小时 - 就绪评分:0.93 完整性与溯源:坐标与分析结果附带可通过CRC32/MD5验证的清单;TTT-7审计标记仅为组织惯例。 许可:CC BY 4.0——开放用于学术及商业治疗用途。 主要研究者:James Paul Trageser 所属机构:Nexus Resonance Codex ORCID:0009-0006-6678-2908 X(Twitter):@jtrag 代码库:https://GitHub.com/Nexus-Resonance-Codex/Drug-Discovery

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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