免疫与自身免疫疾病靶点的精修坐标结构与口袋分析数据集

该数据集聚焦炎症细胞因子、激酶调控因子与免疫检查点(如 TNF、IL6、JAK1、MMP9、FOXP3、HLA-DRB1),提供精修的靶点坐标结构与口袋分析结果,用于设计高选择性小分子抑制剂以调节自身免疫反应并降低脱靶免疫毒性

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Refined Coordinate Structures and Pocket Analyses for Immunology and Autoimmune Disease Targets

基本信息

模态
其他
大小
0.001450484 GB
任务类型
预测
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-13
版本
v2.0-nrc-ultra

资源简介

免疫与自身免疫疾病靶点的精修坐标结构与口袋分析数据集

Refined Coordinate Structures and Pocket Analyses for Immunology and Autoimmune Disease Targets

该数据集聚焦炎症细胞因子、激酶调控因子与免疫检查点(如 TNF、IL6、JAK1、MMP9、FOXP3、HLA-DRB1),提供精修的靶点坐标结构与口袋分析结果,用于设计高选择性小分子抑制剂以调节自身免疫反应并降低脱靶免疫毒性。靶点结构经 NRC CASP-17 Pure Math Folding Engine 优化,采用 C-alpha 谐波引导势约束进行建模,并经过侧链弛豫与口袋扩展模拟识别变构与活性空腔,所有坐标经 Trageser Tensor Theorem 晶格奇偶校验以消除空间冲突(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):数据集标题:免疫与自身免疫疾病靶点的精修坐标结构与口袋分析。概述:聚焦炎症细胞因子、激酶调控因子与免疫检查点(如 TNF、IL6、JAK1、MMP9、FOXP3、HLA-DRB1)。模型旨在设计高选择性小分子抑制剂,以调节自身免疫反应,同时尽量减少脱靶免疫毒性。计算方法:靶点结构使用 NRC CASP-17 Pure Math Folding Engine 进行优化。该流程应用 C-alpha 谐波引导势约束($k_{guide} = 0.5$)进行比较建模(或 $k_{guide} = 0.0$ 用于从头建模),随后进行侧链弛豫和口袋扩展模拟,以识别变构和活性空腔。所有坐标均使用 Trageser Tensor Theorem (TTT-7) 晶格奇偶校验进行审核,以消除空间冲突。

【主题与分类】

主题标签:ACE2、BY、CASP、CC、CFTR、DMD、DPP4、DRB1、F8、F9。本站分类:免疫系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.21132952

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

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源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.21132952

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 1.5 MB。

数据说明

数据集标题:面向免疫学与自身免疫性疾病靶点的精修坐标结构与口袋分析

概述:聚焦于炎性细胞因子、激酶调节因子及免疫检查点(如TNF、IL6、JAK1、MMP9、FOXP3、HLA-DRB1)。模型旨在设计高选择性小分子抑制剂,以调节自身免疫反应,同时尽量减少脱靶免疫毒性。

计算方法:使用NRC CASP-17纯数学折叠引擎优化靶点结构。该流程应用C-α谐波引导势约束($k_{guide} = 0.5$)进行比较建模(或$k_{guide} = 0.0$用于从头建模),随后进行侧链弛豫和口袋扩展模拟,以识别变构和活性腔。所有坐标均使用Trageser张量定理(TTT-7)晶格奇偶校验进行审核,以消除空间冲突(最小原子间距离 > 1.10 Å)和环区幻象。

许可:根据知识共享署名4.0国际许可协议(CC BY 4.0)分发,以支持开放、商业和学术性的治疗药物设计。

首席研究员:James Paul Trageser
所属机构:Nexus Resonance Codex
ORCID:0009-0006-6678-2908
X(Twitter):@jtrag
代码库:https://GitHub.com/Nexus-Resonance-Codex/Drug-Discovery

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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