PRJNA1458246:健康粪便微生物群移植对干燥综合征的影响
该数据集来自 NCBI BioProject,编号 PRJNA1458246,主题为健康粪便微生物群移植对干燥综合征的影响

基本信息
资源简介
PRJNA1458246:健康粪便微生物群移植对干燥综合征的影响
PRJNA1458246 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的生物项目数据集,其英文名称为“Effects of Healthy Fecal Microbiota Transplant on Sjogren's Disease”,中文含义为健康粪便微生物群移植对干燥综合征的影响。该数据集在分类上归属于免疫系统疾病 / 其他,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,主题标签为 Raw sequence reads,即原始序列读长。从项目名称可以看出,该数据集围绕干燥综合征这一免疫系统相关疾病,研究健康粪便微生物群移植对其产生的影响,属于微生物组与免疫系统疾病交叉方向的研究数据。BioProject 作为生物数据的集合记录,为使用者提供统一入口,以便查找该项目所产生的多种类型数据及其相关链接。
【数据集背景】
干燥综合征是一种与免疫系统相关的疾病,而粪便微生物群移植是一种将健康供体的肠道微生物群引入受体的干预方式。该数据集以“健康粪便微生物群移植对干燥综合征的影响”为主题,说明其研究背景涉及肠道微生物群与免疫系统疾病之间的关联。该数据集来源于 NCBI BioProject,编号为 PRJNA1458246,属于免疫系统疾病 / 其他分类。源站描述指出,BioProject 是围绕单一研究计划、来自单一组织或联盟的生物数据集合,BioProject 记录为用户提供一个统一的位置,用于查找为该项目生成的多种数据类型所对应的链接。因此,该数据集本身是一个项目级别的入口,而非单一实验的原始文件集合。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Raw sequence reads,即原始序列读长。这表明该项目所涉及的数据类型以测序产生的原始读长为主。关于具体的样本数量、测序平台、读长长度、数据量、基因或物种注释信息等,源站未提供。该数据集在分类上归属于免疫系统疾病 / 其他,主题围绕健康粪便微生物群移植对干燥综合征的影响。除上述信息外,源站未提供更多关于数据文件结构、数据格式或具体数据内容的说明。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,收录于 NCBI BioProject 数据库,项目编号为 PRJNA1458246。源站描述说明,BioProject 记录来自单一组织或联盟,围绕单一研究计划汇集生物数据。关于样本采集的具体地点、时间、人群、供体与受体的选择标准、伦理审批信息以及实验操作流程等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集的主题为健康粪便微生物群移植对干燥综合征的影响,主题标签为 Raw sequence reads,因此可适用于与肠道微生物群移植、干燥综合征以及免疫系统疾病相关的微生物组测序数据分析场景。使用者可借助 BioProject 记录查找该项目生成的多种数据类型及其链接。关于该数据集是否适用于特定分析流程、临床诊断、药物开发或其他具体应用,源站未提供。
【使用方法】
该数据集以 NCBI BioProject 记录的形式提供,编号为 PRJNA1458246,用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问该项目记录,并借助记录中的链接查找为该项目生成的多种数据类型。关于具体的数据下载方式、分析工具、参数设置或处理流程,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject,属于项目级别的数据集合记录。关于数据质量评估指标、测序深度、覆盖度、批次效应、样本排除标准以及数据完整性等信息,源站未提供。使用者应注意,BioProject 记录本身是查找相关数据的入口,其具体数据质量需结合项目所链接的原始数据进一步判断,而源站未提供相关质量信息。
【引用与许可】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 NCBI BioProject 数据库,项目编号为 PRJNA1458246。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制或版权声明,源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1458246
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究探讨了将健康小鼠的粪便微生物移植到自身免疫性干燥综合征小鼠模型中,是否对唾液腺发挥保护作用,以期为此类难治性疾病中粪便微生物移植的治疗潜力提供新的见解。雌性NOD小鼠是干燥综合征一种常见且特征明确的模型,在4周龄时经抗生素预处理后,接受来自健康C57BL/6供体的FMT。未移植组或接受来自NOD小鼠供体粪便移植的小鼠作为对照。移植后6周评估唾液分泌,移植后7周采集组织和血液,用于分析唾液腺中的白细胞浸润、细胞因子产生和转录组变化。该数据集包含来自健康FMT组和对照组的颌下腺细胞的bulk RNA测序数据。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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