花生过敏粪菌移植试验粪便微生物组宏基因组数据

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花生过敏粪菌移植试验粪便微生物组宏基因组数据

PRJNA1431449 数据集对应一项花生过敏粪菌移植（FMT）试验的宏基因组测序数据，全称为“Fecal Microbiome Transplant in Food Allergy Identifies a Role for Bile Acid Metabolites in Oral Tolerance”。该数据集共包含来自13名患者的26份宏基因组测序文件，每位患者在基线及FMT后4个月各采样一次，因此形成两两配对的样本结构。数据以原始序列读长（Raw sequence reads）的形式提供，归属于免疫系统疾病/其他分类，来源于NCBI（ncbi.nlm.nih.gov）。该数据集可用于考察粪菌移植前后肠道微生物组的变化，并配合同标题发表文献理解胆汁酸代谢物在口服耐受中的作用。

【数据集背景】

该数据集依托一项针对花生过敏患者的粪菌移植临床试验而產生。食物过敏属于免疫系统相关疾病，粪菌移植则是通过重建肠道微生物群落来干预宿主免疫状态的策略。该研究关注FMT对花生过敏患者肠道微生物组的影响，并进一步探讨胆汁酸代谢物在口服耐受建立过程中可能扮演的角色。数据集的英文标题直接点明了这一研究主题，即“粪菌移植在食物过敏中揭示胆汁酸代谢物对口服耐受的作用”。围绕该主题产生的宏基因组测序数据，构成了本数据集的核心内容。关于试验设计细节、受试者纳入标准、临床终点及具体干预方案，源站未提供。

【数据内容】

数据集包含26份宏基因组测序文件，对应13名患者。每位患者贡献两份样本：一份在基线时采集，另一份在FMT后4个月采集。数据主题标签为“Raw sequence reads”，表明提供的是测序仪产生的原始读长数据，而非经过组装、注释或丰度统计的衍生结果。样本总数为26，患者数为13，采样时间点为基线和FMT后4个月两个时点。关于测序平台、读长长度、文件格式、单样本数据量、是否包含宿主序列去除步骤等信息，源站未提供。

【采集与来源】

样本来自参加花生过敏粪菌移植试验的13名患者，采样部位为粪便，采样时间分别为基线和FMT后4个月。数据提交至NCBI，来源站为ncbi.nlm.nih.gov，数据集编号为PRJNA1431449。源站描述建议参考同标题发表文献以获取更多信息。关于样本采集的具体流程、保存条件、DNA提取方法、文库构建策略及测序中心等信息，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肠道微生物组与食物过敏交叉领域的研究。具体而言，可用于分析FMT前后患者粪便宏基因组组成的变化，比较基线与FMT后4个月两个时间点的微生物群落差异；也可用于探索胆汁酸代谢相关基因或通路在口服耐受中的潜在作用，为后续机制研究提供序列层面的数据基础。此外，该数据可作为花生过敏FMT试验的原始测序数据，供方法学比较、数据再分析或与其他微生物组数据集联合分析使用。关于该数据集是否适合特定分析流程或是否已用于其他研究，源站未提供。

【使用方法】

使用者可从NCBI获取这26份原始序列读长文件，并按照宏基因组分析的一般流程进行处理，包括质量控制、去宿主序列、组装或比对、物种分类与功能注释等。由于每位患者具有基线和FMT后4个月两个配对样本，分析时宜采用配对设计以控制个体间差异。若需了解样本分组、临床元数据及具体分析策略，应参考同标题发表文献。关于数据下载的具体访问方式、文件命名规则及配套元数据表，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集样本量有限，共13名患者、26份样本，统计效力受到一定限制。数据为原始序列读长，未提供经过处理的分析结果，使用者需自行完成质量控制与生物信息学分析。数据集仅覆盖基线和FMT后4个月两个时间点，无法反映更细时间尺度的动态变化。关于测序深度、数据质量评分、是否存在批次效应及样本元数据完整度等信息，源站未提供。使用时应结合同标题文献理解研究设计与结果解释的边界。

【引用与许可】

使用该数据集时应引用同标题发表文献，并注明数据来源于NCBI、数据集编号PRJNA1431449。关于该数据集的具体许可条款、使用限制及数据提交者的引用要求，源站未提供。