PRJNA1153046:免疫检查点抑制剂介导的小肠结肠炎发作时微生物组分析WGS

数据内容为免疫检查点抑制剂介导的小肠结肠炎发作时的微生物组分析全基因组测序原始序列读数,可用于研究该疾病发作时微生物组特征及相关分析(来源 ncbi.nlm.nih.gov)

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基因组Raw sequence reads
PRJNA1153046: Microbiome profiling at immune checkpoint inhibitor-mediated enterocolitis onset WGS

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-22

资源简介

PRJNA1153046:免疫检查点抑制剂介导的小肠结肠炎发作时微生物组分析WGS

PRJNA1153046 是一个聚焦于免疫检查点抑制剂介导的小肠结肠炎发作时微生物组特征的全基因组测序数据集,其英文全称为 Microbiome profiling at immune checkpoint inhibitor-mediated enterocolitis onset WGS。该数据集收录的是相关微生物组分析所产生的原始测序序列读数(Raw sequence reads),来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov)。从分类归属看,它被划入免疫系统疾病下的“其他”类别。整体而言,该数据集为研究免疫检查点抑制剂治疗过程中出现小肠结肠炎这一并发症时的微生物组构成与变化提供了原始测序层面的数据基础,可供微生物组学、肿瘤免疫治疗不良反应等相关方向的研究者参考使用。

【数据集背景】

免疫检查点抑制剂是肿瘤免疫治疗中的重要手段,但其引发的免疫相关不良反应,尤其是小肠结肠炎,是临床关注的问题之一。微生物组被认为可能与该类不良反应的发生与表现相关。该数据集正是围绕免疫检查点抑制剂介导的小肠结肠炎发作这一特定时点,开展微生物组分析并产生全基因组测序数据,从而为探索该疾病发作时的微生物组特征提供支持。源站对其的描述为“Microbiome profiling at immune checkpoint inhibitor-mediated enterocolitis onset WGS dataset”。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”,即数据内容为测序产生的原始序列读数。这些读数来自针对免疫检查点抑制剂介导的小肠结肠炎发作时微生物组的全基因组测序分析。数据本身属于原始测序层面,尚未经过汇总或衍生处理,保留了测序仪输出的基础序列信息,适合后续由使用者自行开展微生物组相关的分析与挖掘。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI,源站地址为 ncbi.nlm.nih.gov。关于样本采集的具体地点、时间、受试者数量、采样部位及测序平台等细节,源站未提供。数据集名称中标注的 WGS 表明其采用全基因组测序方式获取微生物组序列信息。

【适用场景】

基于其内容,该数据集可用于研究免疫检查点抑制剂介导的小肠结肠炎发作时的微生物组特征,支持相关的微生物组组成分析、比较分析及其他探索性研究。对于关注肿瘤免疫治疗不良反应与微生物组关系的科研人员,该原始序列数据可作为分析起点。具体可开展的分析类型与研究方向需由使用者根据数据实际情况确定,源站未提供更细化的适用说明。

【使用方法】

使用者可通过 NCBI 获取该数据集对应的原始序列读数,并依据常规微生物组全基因组测序数据的处理流程开展分析。关于数据的具体下载方式、文件组织格式、配套元数据及分析建议,源站未提供进一步说明。

【质量与限制】

该数据集为原始序列读数,未提供质控指标、测序深度、覆盖度等质量参数,源站亦未提供相关质量评估信息。由于缺乏样本层面的详细元数据,使用者在解释分析结果时需注意数据背景信息的局限。其他限制条件源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式与使用许可,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据前,应自行查阅 NCBI 上该数据集条目所附的相关说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1153046

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Microbiome profiling at immune checkpoint inhibitor-mediated enterocolitis onset WGS dataset

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