优化HIV治愈干预队列

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05852301

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：HIV-1感染。与较晚感染阶段启动抗逆转录病毒治疗（ART）的个体相比，在早期HIV感染阶段（感染HIV后6个月内）启动ART的个体中，含有完整且具有复制能力的HIV DNA的细胞频率降低，HIV特异性免疫应答得到更好的保留。既往在人类和感染猕猴模型中的研究表明，较小的病毒储存库（以HIV DNA水平衡量）预示着ART中断后病毒反弹时间更长。这些个体难以识别，且需要专业研究实验室进行HIV DNA检测。因此，迫切需要开发简单高效的流程，以识别HIV储存库较小的围产期HIV感染（PHIV）者，这些个体可能对旨在无需常规ART即可控制病毒的治愈干预措施反应最佳。在START研究（早期HIV感染中启动ART）最近的一项国际子研究中，我们的团队显示，与CD4计数在500-800个细胞/μL之间启动ART的个体相比，CD4 T细胞>800个细胞/μL时启动ART的PHIV者在ART期间实现的HIV储存库显著更小。

我们将这些个体称为“Hi-ARTs”（ART前高CD4）。在ART启动后48个月内CD4计数达到1000个细胞/μL以上的PHIV中也观察到较小的储存库，这些个体被称为“Hypers”。在这些患者群体中，潜伏感染细胞被未感染的CD4 T细胞更有效清除或稀释的免疫学机制尚不清楚。同样不清楚的是，含有基因完整（或具有复制能力）HIV的细胞是否与携带广泛突变/缺失HIV（“缺陷型”）的细胞以相同速率被清除。携带完整或缺陷型HIV的细胞之间的区分很重要，因为只有完整病毒才能在缺乏ART的情况下引起病毒反弹，而且现在已有检测方法可以区分两者。入组时及此后每年一次，持续2年的血液。血浆和外周

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。