卵巢衰老多核巨细胞组织学分析数据

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A48f75242d916e3229e7e8fbcbbad976abca3a04c074cb5d834406f91106a25ce

标准获取流程：

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数据说明

卵巢是最早表现出衰老迹象的器官之一，其特征为组织功能减退、慢性炎症和纤维化。多核巨细胞（MNGCs）由巨噬细胞融合形成，通常出现在慢性免疫病理状态中，包括感染性和非感染性肉芽肿及异物反应，但也在衰老卵巢中被观察到。卵巢MNGCs的功能和后果仍不清楚，因为其生物学活性高度依赖于具体环境，而且其较大的体积限制了通过单细胞RNA测序等技术对其进行分离和分析。在本研究中，我们通过先进成像技术深入分析MNGCs在不同年龄和物种中的存在情况，并利用激光捕获显微切割技术分析其独特的转录组，从而对卵巢MNGCs进行了界定。MNGCs形成复杂的相互连接网络，且在小鼠和非人灵长类动物的卵巢中均随年龄增长而增多。

MNGC的特征是高表达Gpnmb，一种推测的……，，，# 多核巨细胞是卵巢衰老的标志，具有独特的免疫和降解相关分子特征 https://doi.org/10.5061/dryad.kh18932j4 ## 数据和文件结构描述 使用ImageJ对小鼠和非人灵长类卵巢组织切片进行MNGC的组织学定量和阳性抗体染色。为量化MNGC占据的卵巢面积（图1），使用Fiji（NIH）中的可训练Weka分割插件，在非卵巢、非MNGC卵巢和MNGC区域上训练模型。对于图4，阳性CD4或CD3ε面积百分比确定为DAB阳性面积除以包含MNGC、黄体或间质区域的ROI总面积。 ### 文件和变量 #### 文件：Paper_raw_data.xlsx 描述： 来自图1C、1D、4F、4G、4H的ImageJ分析原始数据。 ##### 变量 * 图1C和1D * 月龄（小鼠）和年龄（岁）

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。