CRISPR工程化牛卫星细胞用于AGS兼容培养肉

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE330550

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

α-半乳糖综合征（AGS）是一种可能危及生命的过敏症，由针对半乳糖-α-1,3-半乳糖（α-半乳糖）的IgE介导免疫反应引起，α-半乳糖是存在于大多数哺乳动物肉中的一种碳水化合物表位。目前，严格避免食用哺乳动物肉仍是患者的主要管理策略，且市场上尚无不含α-半乳糖的牛肉产品。在此，我们利用培养肉作为生物技术平台，通过工程化改造不含α-半乳糖的牛肌肉细胞来应对这一未被满足的临床需求。利用CRISPR/Cas9基因组编辑技术，我们破坏了永生化牛卫星细胞中编码α1,3-半乳糖基转移酶的GGTA1基因。高效编辑产生了携带纯合移码突变的克隆性GGTA1敲除细胞系。流式细胞术和免疫荧光证实了α-半乳糖表位的丢失，而bulk RNA-seq表明全局基因表达受到的干扰极小，且肌源性分化能力得以保留。

重要的是，在使用AGS患者血浆进行的检测中，GGTA1敲除细胞的裂解物引起的基础粒细胞活化显著降低，表明基础粒细胞活化减少，这与致敏潜力降低相一致。总之，这些发现为工程化改造AGS兼容的培养肉确立了概念验证，并展示了培养肉技术在应对人类健康挑战方面的潜力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。