LeishDog：覆盖渐进性犬利什曼病的外周血免疫细胞单细胞转录组图谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE313451

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

控制内脏利什曼病（VL）不仅需要应对人类疾病，还需针对动物储存宿主，尤其是家犬——它们是维持人兽共患婴儿利什曼原虫传播的关键宿主。尽管已取得相当大的进展，但无论在人还是犬中，从无症状感染向有症状疾病转变所依据的免疫机制仍不明确。为解决这一未解问题，我们构建了来自自然感染犬和未感染对照的外周免疫细胞综合图谱。LeishDog Atlas捕捉了犬内脏利什曼病（CanL）背后的细胞与转录复杂性，追踪了在进展性、界定明确的疾病阶段中免疫组成和基因表达的变化。值得注意的是，我们鉴定出与重症相关的独特髓系、CD4+和CD8+ T细胞表型。该资源为理解CanL中的全身性免疫失调提供了宝贵框架，并为CanL免疫病理学的比较性、转化性和机制性研究奠定了基础。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。