黑腹果蝇对单一病原体实验适应降低对新型病原体易感性

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Afa30035cc958f56cfd739cdc77e0d8c2e9555e397986a4ff9a1e80937b4d6628

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在自然界中，宿主常常会遇到必须应对的新病原体，即在其近期进化历史中未曾遇到、因而尚未适应的病原体。宿主对这些新病原体的反应以及此类感染的结果，可能受宿主进化历史的影响，尤其是受宿主对其本土病原体（即与其共同进化而来的病原体）适应程度的影响。宿主对一种病原体的适应，可能由于免疫防御的特化以及免疫系统不同分支之间的权衡，而增加其对新型病原体的易感性；也可能凭借交叉抗性而降低对新型病原体的易感性。利用实验室黑腹果蝇种群，我们探究了经实验驯化后能够存活特定细菌病原体感染挑战的宿主，是否也更善于存活新型细菌病原体的感染挑战。我们发现，此类宿主能够存活感染挑战……A. 果蝇种群详情 EPN选择方案：EPN选择方案由三个种群（E、P和N）组成，每个种群有四个区组（1-4）。

E种群每代均接受粪肠球菌感染；P种群为假感染对照；N种群为未感染对照。每个区组内的种群（即E1、P1和N1）共享一个共同祖先。区组同时作为进化重复和实验/统计重复。# IUS选择 regime：IUS选择 regime 由三个种群（I、S和U）组成，每个种群有四个区组（1-4）。I种群每代均接受昆虫病原假单胞菌感染；S种群为假感染对照；U种群为未感染对照。每个区组内的种群（即I1、S1和U1）共享一个共同祖先。区组同时作为进化重复和实验/统计重复。Â B. 选择响应实验 Â EPN选择

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。