禽致病性大肠杆菌蜂窝织炎分离株基因型与致病性分析数据集
该数据集包含144株从肉鸡蜂窝织炎病变分离的禽致病性大肠杆菌(APEC)菌株的基因型与致病性数据,涵盖抗生素敏感性、毒力基因分型、系统发育分型、克隆关系及体内毒力实验等模态,主要用于研究APEC的毒力机制、毒力因子(如粘附、铁获取、血清抗性相关基因)的功能,以及新生儿脑膜炎大肠杆菌特征基因对APEC毒力的调控作用,为兽医微生物学和禽类疾病防控提供分子基础。

基本信息
资源简介
禽致病性大肠杆菌蜂窝织炎分离株基因型与致病性分析数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Genotypes and Pathogenicity of Cellulitis Isolates Reveal Traits That Modulate APEC Virulence》。配套论文《Genotypes and Pathogenicity of Cellulitis Isolates Reveal Traits That Modulate APEC Virulence》发表于 PLoS ONE(2013),DOI:10.1371/journal.pone.0072322。源站首次发布:2013-08-19。
【数据内容】
源站原始描述:We characterized 144 Escherichia coli isolates from severe cellulitis lesions in broiler chickens from South Brazil. Analysis of susceptibility to 15 antimicrobials revealed frequencies of resistance of less than 30% for most antimicrobials except tetracycline (70%) and sulphonamides (60%). The genotyping of 34 virulence-associated genes revealed that all the isolates harbored virulence factors related to adhesion, iron acquisition and serum resistance, which are characteristic of the avian path…
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个,合计 730.22 KB。Figure_S1.pdf:application/pdf,27.10 KB。Figure_S2.tif:image/tiff,703.12 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0072322。
【主题与分类】
源站学科分类:Biological Sciences、Medicine。主题标签:microbiology、Bacterial pathogens、Escherichia coli、Virology、Virulence factors and mechanisms、Applied microbiology、bacteriology、Model organisms、Animal models、chicken。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biological Sciences、Medicine。
【获取与许可】
源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Genotypes_and_Pathogenicity_of_Cellulitis_Isolates_Reveal_Traits_That_Modulate_APEC_Virulence_/775752
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Lima Barbieri, Nicolle; Luísa de Oliveira, Aline; Moreira Tejkowski, Thiago; Brisotto Pavanelo, Daniel; Assumpção Rocha, Débora; Beatriz Matter, Letícia; et al. (2016). Genotypes and Pathogenicity of Cellulitis Isolates Reveal Traits That Modulate APEC Virulence. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-31,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取(Figshare)
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集包含144株从巴西南部肉鸡严重蜂窝织炎病变中分离的大肠杆菌(Escherichia coli)菌株的基因型与致病性分析数据。数据集内容涵盖菌株对15种抗生素的敏感性测试结果、34个毒力相关基因的基因分型、Clermont系统ECOR系统发育分型、基于ARDRA方法的克隆关系分析,以及通过一日龄雏鸡体内实验验证的毒力评估数据。数据来源为实验研究,通过分子生物学和动物模型方法构建。主要研究方向为禽致病性大肠杆菌(APEC)的毒力机制,特别是与粘附、铁获取、血清抗性及质粒相关毒力因子(如ColV质粒基因)的关联,并探索了新生儿脑膜炎大肠杆菌(NMEC)特征基因(如ibeA、gimB、KpsMTII)对APEC毒力的增强作用。
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