E-MTAB-8830:花生四烯酸和/或白细胞介素-6及溶剂对照处理单核细胞衍生巨噬细胞的RNA-seq

该数据集来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验,物种为 Homo sapiens,采用 RNA-seq 技术检测单核细胞衍生巨噬细胞在花生四烯酸和/或白细胞介素-6及溶剂对照处理后的转录组变化

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基因组回归Differential
E-MTAB-8830: RNA-seq of monocyte derived macrophages treated with arachidonic acid and/or interleukin-6 and solvent control

基本信息

模态
基因组
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

E-MTAB-8830:花生四烯酸和/或白细胞介素-6及溶剂对照处理单核细胞衍生巨噬细胞的RNA-seq

E-MTAB-8830 是收录于 EBI Expression Atlas 的一项差异表达实验数据集,物种为 Homo sapiens。该实验采用 RNA-seq 技术,对单核细胞衍生巨噬细胞在花生四烯酸和/或白细胞介素-6以及溶剂对照处理后的转录组进行检测,用以刻画不同处理条件所引起的基因表达变化。数据集在来源站被归类为差异表达实验,本站将其归入免疫系统疾病 / 其他类别,主题标签为 Differential。整体而言,该数据集围绕人源单核细胞衍生巨噬细胞的体外处理模型展开,通过转录组测序比较处理组与溶剂对照之间的表达差异,可为研究花生四烯酸与白细胞介素-6对巨噬细胞转录状态的影响提供数据基础。

【数据集背景】

该数据集来源于 EBI Expression Atlas,属于其中的差异表达实验(Differential)。Expression Atlas 是面向基因表达实验的公共资源,差异表达实验通常用于比较不同实验条件之间基因表达水平的相对变化。E-MTAB-8830 的研究对象为人单核细胞衍生巨噬细胞,实验涉及花生四烯酸、白细胞介素-6以及溶剂对照三类处理条件,其中花生四烯酸与白细胞介素-6可单独或联合使用。该数据集的主题标签为 Differential,本站分类为免疫系统疾病 / 其他,提示其与免疫相关研究场景存在关联。

【数据内容】

数据集的核心内容是单核细胞衍生巨噬细胞经花生四烯酸和/或白细胞介素-6及溶剂对照处理后的 RNA-seq 转录组数据。实验设计包含处理组与溶剂对照组,通过测序获取转录组信息,并用于差异表达分析。源站描述明确指出该实验为差异表达实验,物种为 Homo sapiens,技术类型为 RNA-seq。关于样本数量、测序深度、具体差异表达基因数目、表达量统计指标等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来自 ebi.ac.uk,即 EBI Expression Atlas 中的一项实验记录,实验编号为 E-MTAB-8830。源站描述给出了实验标题、物种、实验类型与技术手段等基本信息。关于样本采集的具体流程、细胞培养与处理条件、测序平台型号、建库方法、测序读长与试剂信息等实验细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于研究人单核细胞衍生巨噬细胞在花生四烯酸和/或白细胞介素-6处理下的转录组响应,可用于差异表达分析、处理条件之间的表达模式比较,以及围绕巨噬细胞免疫相关转录调控的探索性研究。由于本站将其归入免疫系统疾病 / 其他类别,该数据也可作为免疫相关研究中的参考表达数据。关于该数据集在特定疾病模型或临床研究中的直接应用,源站未提供。

【使用方法】

该数据集为 RNA-seq 差异表达实验数据,使用者可依据 Expression Atlas 中该实验的记录获取数据并进行表达差异比较。关于数据文件的具体格式、下载方式、分析流程、标准化方法以及配套分析工具等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 EBI Expression Atlas 收录的差异表达实验,物种与实验类型信息明确。关于数据质量评估指标、重复样本数量、批次效应、测序质量参数以及实验结论的适用范围与局限性,源站未提供。使用者应注意该实验为体外细胞处理模型,其结果不宜直接外推至体内或临床情境,具体限制信息源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来自 EBI Expression Atlas,实验编号为 E-MTAB-8830。关于该数据集的引用方式、许可协议与使用条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-MTAB-8830

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. RNA-seq of monocyte derived macrophages treated with arachidonic acid and/or interleukin-6 and solvent control

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