E-MTAB-6865:人PBMC来源或CD3/CD28刺激或移植小鼠脾脏T细胞的RNA-Seq
数据为RNA-Seq,样本包括从人PBMC分选的T细胞、经CD3/CD28磁珠刺激4天的T细胞,以及移植人PBMC后7天取自NSG或NSG-HLA-A2/HHD小鼠脾脏的T细胞

基本信息
资源简介
E-MTAB-6865:人PBMC来源或CD3/CD28刺激或移植小鼠脾脏T细胞的RNA-Seq
E-MTAB-6865 是一项关于 T 细胞的 RNA-Seq 表达谱实验数据集,归属于免疫系统疾病/其他分类,来源于 ebi.ac.uk 的 Expression Atlas 实验(差异表达类型)。该数据集以 Homo sapiens 为物种,围绕人 T 细胞在体外刺激与异种移植两种情境下的转录组展开:样本既包括从人 PBMC 中分选得到的 T 细胞,也包括经 CD3/CD28 磁珠刺激 4 天的 T 细胞,还包括将人 PBMC 移植入 NSG 或 NSG-HLA-A2/HHD 小鼠后第 7 天从小鼠脾脏中获取的 T 细胞。整体上,该数据集为比较不同来源与处理条件下人 T 细胞的基因表达差异提供了 RNA-Seq 层面的实验材料。
【数据集背景】
该数据集属于 Expression Atlas 中的差异表达实验,主题标签为 Differential,说明其设计目的指向不同实验条件之间基因表达差异的检测与呈现。研究关注的对象是人 T 细胞,涉及体外激活状态与体内异种移植环境两类背景。源站描述明确物种为 Homo sapiens,表明所测转录组来自人的细胞,即便部分样本取材于小鼠脾脏,其分析对象仍是移植后存在于小鼠体内的人 T 细胞。该数据集归入免疫系统疾病/其他类别,提示其与免疫系统相关研究场景存在关联。
【数据内容】
数据内容为 RNA-Seq 表达数据,覆盖三类样本来源:一是从人 PBMC 中分选获得的 T 细胞;二是经 CD3/CD28 磁珠刺激 4 天的 T 细胞;三是移植人 PBMC 后 7 天取自 NSG 或 NSG-HLA-A2/HHD 小鼠脾脏的 T 细胞。上述样本共同构成差异表达分析的材料基础。源站未提供关于样本数量、测序深度、读长、表达定量指标或差异基因数目等具体数值信息。
【采集与来源】
数据来源站为 ebi.ac.uk,属于 Expression Atlas 实验记录。样本采集涉及人 PBMC 来源的 T 细胞分选、CD3/CD28 磁珠刺激培养 4 天,以及 NSG 与 NSG-HLA-A2/HHD 两类小鼠在移植人 PBMC 后第 7 天取脾脏获取 T 细胞。源站未提供更详细的采集流程、伦理审批信息或具体实验地点。
【适用场景】
该数据集适用于研究人 T 细胞在不同激活与体内环境条件下的转录组差异,例如比较分选 T 细胞与 CD3/CD28 刺激后 T 细胞的表达变化,或考察移植入 NSG 与 NSG-HLA-A2/HHD 小鼠后脾脏中人 T 细胞的表达特征。其差异表达主题也适合用于免疫学相关的基础研究场景。源站未提供具体的下游应用案例或验证结论。
【使用方法】
该数据集以 Expression Atlas 实验形式提供,可按差异表达实验的常规方式用于表达谱查看与比较分析。源站未提供具体的下载格式、分析流程、软件参数或代码示例。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量评估、批次效应、重复数或技术偏差的具体说明。由于涉及异种移植模型与体外刺激两类差异较大的条件,使用时应关注条件间可比性,但源站未给出相关限制说明。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-MTAB-6865
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
表达图谱实验(差异分析)。物种:智人。RNA-Seq:从人PBMC中分选出的T细胞,或经CD3/CD28磁珠刺激4天的T细胞,或移植人PBMC后7天取自NSG或NSG-HLA-A2/HHD小鼠脾脏的T细胞。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




