数据:易感两栖动物皮肤脱落率随壶菌感染负荷增加
该数据集来自 Dryad,对应 2015 年发表的研究,关注易感两栖动物澳大利亚绿树蛙(Litoria caerulea)在暴露于本地 Batrachochytrium dendrobatidis(Bd)菌株后,皮肤脱落率与个体感染负荷之间的关系

基本信息
资源简介
数据:易感两栖动物皮肤脱落率随壶菌感染负荷增加
Data from: Skin sloughing rate increases with chytrid fungus infection load in a susceptible amphibian
该数据集来自 Dryad,对应 2015 年发表的研究,关注易感两栖动物澳大利亚绿树蛙(Litoria caerulea)在暴露于本地 Batrachochytrium dendrobatidis(Bd)菌株后,皮肤脱落率与个体感染负荷之间的关系。数据覆盖皮肤维护过程与壶菌病进展的关联,可用于分析皮肤脱落是否随感染负荷变化,以及其在宿主易感性和疾病发病机制中的潜在作用(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2015。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):1. 两栖动物壶菌病由真菌病原体 Batrachochytrium dendrobatidis(Bd)引起,是有记录以来造成脊椎动物生物多样性丧失最严重的疾病驱动因素。对宿主易感性的驱动因素的理解,因我们对宿主-病原体关系认识的空白而受到阻碍。易感性中一个被忽视的方面是皮肤维护过程的变异,特别是通过常规脱落进行的皮肤更新。有人提出,脱落通过去除皮肤相关微生物在免疫防御中发挥作用。因此,皮肤脱落可能在壶菌病的发病机制中发挥重要作用。2. 为确定皮肤脱落与疾病进展之间的关系,我们将成年澳大利亚绿树蛙(Litoria caerulea)暴露于本地 Bd 菌株,并监测脱落率和个体感染负荷
【主题与分类】
主题标签:Litoria caerulea、fungal pathogen、susceptibility、physiological homeostasis、chytridiomycosis、skin sloughing、infection load、amphibian disease、Batrachochytrium dendrobatidis。本站分类:免疫系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.h1j85
使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://doi.org/10.5061/dryad.h1j85
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 126.3 KB。
数据说明
- 由真菌病原体蛙壶菌(Batrachochytrium dendrobatidis, Bd)引起的两栖动物壶菌病,导致了有记录以来由疾病驱动的最严重的脊椎动物生物多样性丧失。我们对宿主-病原体关系的认识不足,阻碍了理解宿主对这种皮肤疾病易感性的驱动因素。易感性中一个被忽视的方面是皮肤维护过程的变化,特别是通过常规蜕皮进行的皮肤更新。有观点认为,蜕皮通过去除皮肤相关微生物在免疫防御中发挥作用。因此,皮肤蜕皮可能在壶菌病的发病机制中扮演重要角色。2. 为了确定皮肤蜕皮与疾病进展之间的关系,我们将成年澳大利亚绿树蛙(Litoria caerulea)暴露于本地Bd菌株,并在模拟自然循环温度条件(15–23°C)下监测蜕皮率和个体感染负荷。3. 我们通过使用红外摄像机阵列实时拍摄青蛙行为来确定蜕皮率,并通过拭子采样及定量PCR分析,在蜕皮前后监测感染负荷。4.
我们发现,在受感染的蛙中,蜕皮率随Bd感染负荷增加而升高,但蜕皮本身并未影响腹侧皮肤表面的Bd负荷。此外,Bd感染并未影响特征性蜕皮行为的持续时间,即使在高感染负荷下,蜕皮仍保持节律性。5. 尽管蜕皮率增加可能被认为对感染Bd的动物有利,但它似乎并未遏制疾病进展,反而可能通过进一步抑制水和电解质跨皮肤运输,导致终末期病蛙所见的生理稳态丧失。6. 通过首次直接测量蜕皮率,我们的结果揭示了Bd如何与皮肤生理过程相互作用,并表明皮肤s
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




