易感与抗性两栖动物皮肤脱落调控真菌病原体感染数据
该数据集来自 Dryad,记录了五种澳大利亚蛙类暴露于真菌病原体 Batrachochytrium dendrobatidis(Bd)后的皮肤脱落率与感染负荷随时间的变化

基本信息
资源简介
易感与抗性两栖动物皮肤脱落调控真菌病原体感染数据
Data from: Skin sloughing in susceptible and resistant amphibians regulates infection with a fungal pathogen
该数据集来自 Dryad,记录了五种澳大利亚蛙类暴露于真菌病原体 Batrachochytrium dendrobatidis(Bd)后的皮肤脱落率与感染负荷随时间的变化。研究覆盖易感与抗性物种,用于分析皮肤脱落是否调控 Bd 在皮肤上的种群增长及后续感染动态。数据可支持感染负荷预测、脱落率与易感性关系建模等回归分析,有助于理解两栖动物对壶菌病的种间差异(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2018。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):真菌病原体 Batrachochytrium dendrobatidis(Bd)被认为与全球两栖动物种群下降有关。鉴于变态后两栖动物的 Bd 感染仅限于皮肤,常规的皮肤脱落可能调控感染。皮肤脱落已被证明可减少两栖动物皮肤上可培养微生物的数量,且在高负荷下 Bd 感染会增加皮肤脱落率。然而,尚不清楚皮肤脱落模式的物种特异性差异是否能调控皮肤上 Bd 种群的增长,并影响随后的感染动态。我们将五种澳大利亚蛙类暴露于 Bd,并随时间监测脱落率和感染负荷。在全部五个物种中,尽管对疾病的易感性差异很大,脱落均降低了腹侧皮肤表面的 Bd 负荷。在最不易感的物种中,脱落率在低
【主题与分类】
主题标签:Limnodynastes tasmaniensis、Litoria caerulea、susceptibility、Limnodynastes peronii、chytrid fungus、chytridiomycosis、skin shedding、Platyplectrum ornatum、Lechriodus fletcheri、Batrachochytrium dendrobatidis。本站分类:免疫系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.j464h
使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。
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- OpenDataLab:
数据集大小约 230.2 KB。
数据说明
真菌病原体蛙壶菌(Batrachochytrium dendrobatidis,Bd)被认为与全球两栖动物种群数量下降有关。鉴于变态后两栖动物的Bd感染仅限于皮肤,常规的皮肤脱落可能对感染具有调节作用。已有研究表明,皮肤脱落可减少两栖动物皮肤上可培养微生物的数量,并且在高负荷下Bd感染会增加皮肤脱落率。然而,目前尚不清楚皮肤脱落模式的种间差异是否能调节皮肤上Bd种群的增长,并影响随后的感染动态。我们将五种澳大利亚蛙类暴露于Bd,并随时间监测其脱落率和感染负荷。尽管这五个物种对疾病的易感性差异很大,但在所有五个物种中,脱落均降低了腹侧皮肤表面的Bd负荷。在易感性最低的物种中,感染负荷较低时脱落率即增加,且脱落使Bd负荷降低高达100%,从而导致感染清除。相反,在易感性较高的物种中,脱落导致的Bd负荷下降仅是暂时的。
这些发现表明,脱落作为有效免疫防御的能力具有物种特异性,并且对于理解单个宿主上Bd种群增长的模式以及种群层面的影响具有重要意义。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




