易感与抗性两栖动物皮肤脱落调控真菌病原体感染数据

该数据集来自 Dryad,记录了五种澳大利亚蛙类暴露于真菌病原体 Batrachochytrium dendrobatidis(Bd)后的皮肤脱落率与感染负荷随时间的变化

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其他回归Limnodynastes tasmaniensisLitoria caeruleasusceptibilityLimnodynastes peroniichytrid funguschytridiomycosisskin sheddingPlatyplectrum ornatumLechriodus fletcheriBatrachochytrium dendrobatidis
Data from: Skin sloughing in susceptible and resistant amphibians regulates infection with a fungal pathogen

基本信息

模态
其他
大小
0.000230219 GB
任务类型
回归
许可
Creative Commons Zero v1.0 Universal
创建/更新时间
2026-11-03

资源简介

易感与抗性两栖动物皮肤脱落调控真菌病原体感染数据

Data from: Skin sloughing in susceptible and resistant amphibians regulates infection with a fungal pathogen

该数据集来自 Dryad,记录了五种澳大利亚蛙类暴露于真菌病原体 Batrachochytrium dendrobatidis(Bd)后的皮肤脱落率与感染负荷随时间的变化。研究覆盖易感与抗性物种,用于分析皮肤脱落是否调控 Bd 在皮肤上的种群增长及后续感染动态。数据可支持感染负荷预测、脱落率与易感性关系建模等回归分析,有助于理解两栖动物对壶菌病的种间差异(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2018。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):真菌病原体 Batrachochytrium dendrobatidis(Bd)被认为与全球两栖动物种群下降有关。鉴于变态后两栖动物的 Bd 感染仅限于皮肤,常规的皮肤脱落可能调控感染。皮肤脱落已被证明可减少两栖动物皮肤上可培养微生物的数量,且在高负荷下 Bd 感染会增加皮肤脱落率。然而,尚不清楚皮肤脱落模式的物种特异性差异是否能调控皮肤上 Bd 种群的增长,并影响随后的感染动态。我们将五种澳大利亚蛙类暴露于 Bd,并随时间监测脱落率和感染负荷。在全部五个物种中,尽管对疾病的易感性差异很大,脱落均降低了腹侧皮肤表面的 Bd 负荷。在最不易感的物种中,脱落率在低

【主题与分类】

主题标签:Limnodynastes tasmaniensis、Litoria caerulea、susceptibility、Limnodynastes peronii、chytrid fungus、chytridiomycosis、skin shedding、Platyplectrum ornatum、Lechriodus fletcheri、Batrachochytrium dendrobatidis。本站分类:免疫系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.j464h

使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 230.2 KB。

数据说明

真菌病原体蛙壶菌(Batrachochytrium dendrobatidis,Bd)被认为与全球两栖动物种群数量下降有关。鉴于变态后两栖动物的Bd感染仅限于皮肤,常规的皮肤脱落可能对感染具有调节作用。已有研究表明,皮肤脱落可减少两栖动物皮肤上可培养微生物的数量,并且在高负荷下Bd感染会增加皮肤脱落率。然而,目前尚不清楚皮肤脱落模式的种间差异是否能调节皮肤上Bd种群的增长,并影响随后的感染动态。我们将五种澳大利亚蛙类暴露于Bd,并随时间监测其脱落率和感染负荷。尽管这五个物种对疾病的易感性差异很大,但在所有五个物种中,脱落均降低了腹侧皮肤表面的Bd负荷。在易感性最低的物种中,感染负荷较低时脱落率即增加,且脱落使Bd负荷降低高达100%,从而导致感染清除。相反,在易感性较高的物种中,脱落导致的Bd负荷下降仅是暂时的。

这些发现表明,脱落作为有效免疫防御的能力具有物种特异性,并且对于理解单个宿主上Bd种群增长的模式以及种群层面的影响具有重要意义。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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