幽门螺杆菌通过积累NF-кB蛋白诱导新型先天免疫记忆的数据集

主题标签:幽门螺杆菌、先天免疫记忆、NF-кB蛋白、免疫系统疾病、蛋白质组学。本数据集为免疫系统疾病领域公开数据集,主题涵盖幽门螺杆菌。

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蛋白质幽门螺杆菌先天免疫记忆NF-кB蛋白免疫系统疾病蛋白质组学
Data from: Helicobacter pylori induces a novel form of innate immune memory via accumulation of NF-кB proteins

基本信息

模态
蛋白质
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

幽门螺杆菌通过积累NF-кB蛋白诱导新型先天免疫记忆的数据集

该数据集英文名为 Data from: Helicobacter pylori induces a novel form of innate immune memory via accumulation of NF-кB proteins,来自 ebi.ac.uk,源站将其归入免疫系统疾病 / 其他分类。数据集围绕幽门螺杆菌(Helicobacter pylori)诱导的先天免疫记忆展开,核心关注 NF-кB 蛋白积累这一机制,并带有蛋白质组学主题标签。源站描述显示,该数据集由 Veronika Schäpertöns 于 2023 年发布,收录于 PRIDE Archive,项目编号为 PXD045072。整体而言,这是一份面向免疫系统疾病领域的公开数据集,主题涵盖幽门螺杆菌、先天免疫记忆与 NF-кB 蛋白,适合对该方向感兴趣的科研人员检索与参考。

【数据集背景】

该数据集的研究背景聚焦于幽门螺杆菌与先天免疫记忆之间的关系。幽门螺杆菌是一种常见的病原体,其与宿主免疫系统的相互作用长期受到关注。数据集的标题明确指出,幽门螺杆菌通过 NF-кB 蛋白的积累诱导一种新型的先天免疫记忆形式。这一主题将病原体感染、先天免疫应答与蛋白质组学联系在一起,属于免疫系统疾病领域的公开数据资源。源站将该数据集归入免疫系统疾病 / 其他分类,说明其内容与免疫相关疾病研究存在关联。

【数据内容】

数据集的主题标签包括幽门螺杆菌、先天免疫记忆、NF-кB 蛋白、免疫系统疾病和蛋白质组学。从标题与标签可以看出,数据内容围绕幽门螺杆菌感染背景下 NF-кB 蛋白的积累现象及其与先天免疫记忆的关联展开。数据集属于蛋白质组学范畴,源站将其收录于 PRIDE Archive,项目编号为 PXD045072。关于具体的样本数量、实验分组、蛋白鉴定数量等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,源站描述中给出的引用信息为 Veronika Schäpertöns(2023)发布的数据集,标题与数据集英文名一致,并附有 PRIDE Archive 项目链接 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD045072。数据集的发布年份为 2023 年。关于样本采集地点、采集时间、实验平台与仪器型号等具体采集信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于免疫系统疾病领域的研究参考,尤其是涉及幽门螺杆菌感染、先天免疫记忆以及 NF-кB 蛋白相关机制的研究方向。由于带有蛋白质组学主题标签,也可供蛋白质组学相关分析场景参考。数据集为公开数据集,可用于科研检索与二次分析等用途。关于具体的适用分析类型或验证场景,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 ebi.ac.uk 的 PRIDE Archive 项目页面访问,项目编号为 PXD045072。使用者可依据源站提供的项目链接获取数据集。关于数据文件格式、下载方式、预处理步骤或分析流程等具体使用说明,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为公开数据集,来源站为 ebi.ac.uk,收录于 PRIDE Archive。关于数据质量评估指标、数据完整性、样本量、技术重复情况以及已知偏差等具体信息,源站未提供。使用者在使用时应结合源站页面自行核实相关细节。

【引用与许可】

引用该数据集时,可参考源站描述中的引用信息:Veronika Schäpertöns(2023). Helicobacter pylori induces a novel form of innate immune memory via accumulation of NF-кB proteins [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD045072。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD045072

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Veronika Schäpertöns (2023). Helicobacter pylori induces a novel form of innate immune memory via accumulation of NF-кB proteins [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD045072

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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