早产与足月慢性胎盘炎症多组学图谱
该数据集来自 search.dataone.org,构建了早产与足月妊娠慢性胎盘炎症(CPI)的多组学整合图谱,覆盖胎盘及胎盘外组织

基本信息
资源简介
早产与足月慢性胎盘炎症多组学图谱
A multi-omic atlas reveals distinct immune landscapes in preterm and term chronic placental inflammation
该数据集来自 search.dataone.org,构建了早产与足月妊娠慢性胎盘炎症(CPI)的多组学整合图谱,覆盖胎盘及胎盘外组织。数据整合了成像质谱流式、单细胞RNA测序、空间转录组、TCR库挖掘和DNA甲基化分析,揭示CPI是随孕龄变化的免疫连续谱而非单一炎症状态。可用于研究早产相关慢性炎症的细胞与分子机制、免疫微环境差异及生殖免疫学分析(来源 DataONE,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):慢性胎盘炎症(CPI)包含一系列与早产(PTB)相关的慢性炎症性病变,但其跨妊娠期的细胞和分子决定因素仍不清楚。在此,我们通过成像质谱流式、单细胞RNA测序、空间转录组学、TCR库挖掘和DNA甲基化分析,对早产和足月妊娠的胎盘及胎盘外组织进行 profiling,构建了CPI的综合多组学图谱。CPI 呈现为一种孕龄依赖的免疫连续谱,而非统一的炎症状态。早产CPI表现为细胞毒性CD8⁺ T细胞、活化巨噬细胞和NK细胞在胎盘外膜中不受限制地浸润,形成自我放大的炎症回路。相比之下,足月CPI表现为空间受限的免疫微环境,富集稳态髓系细胞和调节性
【主题与分类】
主题标签:Placenta、Preterm birth、Reproductive immunology。本站分类:免疫系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3A5a4933685f7b54239ac2270b42c3ce121722a1f5e11b80887b9231ffcbe5e14a
使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。
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- OpenDataLab:
数据说明
慢性胎盘炎症(CPI)涵盖一系列与早产(PTB)相关的慢性炎症性病变,然而其在整个妊娠期的细胞与分子决定因素仍不明确。在此,我们通过成像质谱流式细胞术、单细胞RNA测序、空间转录组学、TCR库挖掘及DNA甲基化分析,对早产与足月妊娠的胎盘及胎盘外组织进行 profiling,构建了CPI的综合多组学图谱。CPI呈现为一种随胎龄变化的免疫连续谱,而非均一的炎症状态。早产CPI表现为细胞毒性CD8⺠T细胞、活化巨噬细胞及NK细胞在胎盘外膜中不受限制地浸润,形成自我放大的炎症环路。相比之下,足月CPI表现为空间局限的免疫微环境,富集稳态髓系细胞与调节性T细胞,尽管炎症持续存在,仍维持母胎耐受。
多组学整合……所有人类受试者均提供了书面知情同意,本研究仅呈现去标识化数据。
多组学图谱揭示早产与足月慢性胎盘炎症中不同的免疫景观
数据集 DOI:10.5061/dryad.np5hqc084
数据与文件结构说明
胎盘去标识化标本依据 WSU/NICHD/PRB 方案采集(WSU IRB 编号:110605MP2F、61217MP2F 和 031318MP2F)。这些标本的采集与处理由前围产期研究分部(PRB)、院内研究部、Eunice Kennedy Shriver 国家儿童健康与人类发展研究所、美国国立卫生研究院、美国卫生与公众服务部(NICHD/NIH/DHHS)资助。该资助由 NICHD/NIH/DHHS 根据合同编号 HHSN275201300006C 提供的联邦资金支持。样本采集前,所有参与者均提供了书面知情同意。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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