免疫表位数据库导出
IEDB 是过敏和免疫研究中常用的公开免疫表位数据库，提供抗体和T细胞表位、抗原、实验检测结果和文献证据，可用于过敏原识别、表位分类、免疫反应建模及交叉反应分析。
基本信息
资源简介
免疫表位数据库导出
【一句话概览】
IEDB 数据库导出信息可在开发者论坛查看，提供 XML、MySQL、CSV、TSV、Excel、Json 等多种格式的完整或分类导出，涵盖 epitope、antigen、tcell、bcell、mhc_ligand、receptor、tcr、bcr、iedb_3d、airr 等数据，并附数据库架构文件、实体关系图及 Stable ID 导出。数据经人工整理，来自出版物或提交数据集，均关联 PubMed 或提交标识并归属作者，采用 CC BY 4.0 许可（来源 iedb.org）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《IEDB Database Export》。
【数据内容】
源站原始描述：Information about our database export features can be found in our developer''s forum. XML Database Export Complete Database Export 631MB IedbAccessionList.zip 92kB MhcAlleleNameList.zip 535kB OrganismList.zip 46MB AssayTypeList.zip 6kB GeoLocList.zip 3kB IEDB Schema Curation.xsd (Primary IEDB schema) 50kB CurationSimpleTypes.xsd 354kB IedbAccessionList.xsd 909B MhcAlleleNameList.xsd 1kB OrganismList.xsd 751B AssayTypeList.xsd 771B GeoLocList.xsd 642B MySQL Database Export SQL Statement Export 65…
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：有关我们数据库导出功能的信息，请参见我们的开发者论坛。XML 数据库导出 完整数据库导出 631MB IedbAccessionList.zip 92kB MhcAlleleNameList.zip 535kB OrganismList.zip 46MB AssayTypeList.zip 6kB GeoLocList.zip 3kB IEDB Schema Curation.xsd（IEDB 主 schema）50kB CurationSimpleTypes.xsd 354kB IedbAccessionList.xsd 909B MhcAlleleNameList.xsd 1kB OrganismList.xsd 751B AssayTypeList.xsd 771B GeoLocList.xsd 642B MySQL 数据库导出 SQL 语句导出 656MB MyISAM 二进制导出 1GB 物理实体关系图 iedb_public_erd.pdf 31kB CSV 指标导出 epitope_full_v3.zip 102MB antigen_full_v3.zip 3MB tcell_full_v3.zip 43MB bcell_full_v3（single_file.zip）（multi_file.zip）87MB mhc_ligand_full（single_file.zip）（multi_file.zip）287MB reference_full_v3.zip 3MB receptor_full_v3.zip 10MB tcr_full_v3.zip 9MB bcr_full_v3.zip 1MB iedb_3d_full.zip 5MB TSV 指标导出 epitope_full_v3_tsv.zip 102MB antigen_full_v3_tsv.zi…
【主题与分类】
主题标签：epitope、antigen、tcell、bcell、mhc_ligand、receptor、tcr、bcr、iedb_3d、airr。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.iedb.org/database_export_v3.php
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://www.iedb.org/database_export_v3.php
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
IEDB 提供免疫表位、抗原、宿主、实验检测和文献来源数据，可用于过敏原表位、IgE反应和免疫识别分析。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
数据缺失？
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