ANCA相关血管炎全血RNA测序
EGAS00001006704 虽以 GPA/MPA 为主，但属于 ANCA 相关血管炎公开组学资源，可用于 EGPA 邻近血管炎通路比较、炎症分类和血液转录组特征分析。
基本信息
资源简介
ANCA相关血管炎全血RNA测序
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Whole blood transcriptomic analysis of ANCA-associated vasculitis》。
【数据内容】
源站原始描述：Whole blood mRNA sequencing from 30 patients with AAV (granulomatosis with polyangiitis/GPA, n=22) and microscopic polyangiitis (MPA, n=8) combined with functional enrichment and network analysis for aberrant pathways. Key genes and pathways were validated in an independent cohort of 18 AAV patients. Co-expression network and hierarchical clustering analysis, identified molecular endotypes. Multi-level transcriptional overlap analysis to SLE was based on our published data from 142 patients. Who…
【主题与分类】
主题标签：Other。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://ega-archive.org/studies/EGAS00001006704
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://ega-archive.org/studies/EGAS00001006704
标准获取流程：
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
EGA 研究包含 ANCA 相关血管炎患者和健康对照全血 RNA 测序，可用于 EGPA邻近血管炎比较。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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