EGAS00001004489-2-sc-2022-02-17T14:43:00Z 样本数据

源站描述指出,CVID是最常见的原发性免疫缺陷病,作者对CVID不一致的同卵双生子进行单细胞组学分析,揭示与记忆B细胞激活相关的表观遗传和转录改变

omicsdi
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其他分类2019 novel coronavirus infection2019-nCoV infectioncoronavirus disease 2019COVID-19SARS-coronavirus 2SARS-CoV-2
EGAS00001004489-2-sc-2022-02-17T14:43:00Z - samples

基本信息

模态
其他
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

EGAS00001004489-2-sc-2022-02-17T14:43:00Z 样本数据

该数据集英文名为 EGAS00001004489-2-sc-2022-02-17T14:43:00Z - samples,在分类上归属于免疫系统疾病下的普通变异型免疫缺陷病,来源站为 omicsdi.org。源站描述指出,普通变异型免疫缺陷病(CVID)是最常见的原发性免疫缺陷病;作者对CVID不一致的同卵双生子开展单细胞组学分析,揭示了与记忆B细胞激活相关的表观遗传和转录改变。该数据集的主题标签集中于2019新型冠状病毒感染相关术语,包括2019 novel coronavirus infection、2019-nCoV infection、coronavirus disease 2019、COVID-19、SARS-coronavirus 2、SARS-CoV-2 以及 severe acute respiratory syndrome coronavirus 2。整体而言,该数据集围绕CVID这一原发性免疫缺陷病,借助同卵双生子设计下的单细胞组学手段,关注记忆B细胞激活过程中的表观遗传与转录层面变化,并带有新冠病毒感染相关主题标注,可供免疫系统疾病研究参考。

【数据集背景】

普通变异型免疫缺陷病(CVID)是最常见的原发性免疫缺陷病。源站描述表明,该研究以CVID不一致的同卵双生子为对象,采用单细胞组学分析手段,考察与记忆B细胞激活相关的表观遗传和转录改变。这一设计利用同卵双生子在遗传背景上的可比性,聚焦于疾病不一致状态下的分子层面差异。数据集所属分类为免疫系统疾病 / 普通变异型免疫缺陷病,来源站为 omicsdi.org。

【数据内容】

该数据集以样本(samples)形式组织,英文名中包含“samples”标识。源站描述提及的分析内容为单细胞组学分析,涉及表观遗传和转录两个层面的改变,分析对象为CVID不一致同卵双生子中的记忆B细胞激活相关变化。主题标签覆盖2019新型冠状病毒感染、COVID-19、SARS-CoV-2 等相关术语。除上述信息外,样本数量、具体组学模态、检测平台、数据文件类型与规模等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源站为 omicsdi.org。源站描述说明研究采用CVID不一致的同卵双生子样本开展单细胞组学分析。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、具体样本处理流程以及原始数据产生平台等,源站未提供。

【适用场景】

基于源站描述,该数据集适用于与普通变异型免疫缺陷病相关的免疫学研究,尤其是围绕记忆B细胞激活的表观遗传与转录改变的分析;同卵双生子不一致设计也可用于探讨遗传背景相同条件下疾病相关分子差异的研究场景。主题标签中的新冠病毒感染相关术语提示其可能与COVID-19相关研究主题存在关联。具体适用分析类型与下游应用,源站未提供。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据获取方式、文件格式说明、预处理步骤、分析流程与软件工具建议等。

【质量与限制】

源站未提供该数据集的质量评估信息、数据完整性说明、批次效应控制情况以及已知技术限制。使用时应以源站描述所界定的研究范围为限,不宜外推至未提及的人群或组学层面。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可条款信息。

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数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001008575

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

常见变异型免疫缺陷病(CVID)是最常见的原发性免疫缺陷病。本文作者对CVID不一致的单卵双胞胎进行单细胞组学分析,并揭示了与记忆B细胞活化相关的表观遗传和转录改变。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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