过敏性休克小鼠模型转录组
GSE215184 是过敏性休克模型相关的 GEO 数据集，提供小鼠实验模型中的转录组数据，可用于过敏性休克机制研究、跨物种比较和免疫通路分类分析。
基本信息
资源简介
过敏性休克小鼠模型转录组
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Integrative transcriptomic analysis in human and mouse models of anaphylaxis identifies upregulation of cell movement, migration and neuroinflammatory signalling pathway》。源站首次发布：Oct 10 202。
【数据内容】
源站原始描述：The underlying mechanisms of IgE-mediated anaphylaxis remain poorly understood. Furthermore, it remains to be determined to what extent findings from animal/mouse models reflects the pathophysiological mechanism in human. Therefore, to better characterize the mechanisms leading to potentially lethal events, analysis of global transcriptional changes (RNA-sequencing) in peripheral blood human samples in patients with anaphylaxis presenting at the emergency department and in patients with anaphyla…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by high throughput sequencing、GPL20301、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE215184
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 11 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE215184
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
GSE215184 收录小鼠过敏性休克模型转录组数据，用于比较过敏性休克相关基因特征。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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