GSE165539：下一代测序助力B细胞转录组定量分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE165539

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

高亲和力结合变应原的IgE抗体的出现与过敏反应的严重程度高度相关。然而，高亲和力IgE产生的潜在分子机制仍知之甚少。为研究T细胞来源的IL-13在产生IgE的B细胞发育中的功能，我们将IL-13充足或缺陷的OT-2 TH2细胞转移至IgE报告基因(Verigem)小鼠，随后用NP-OVA进行免疫。免疫后第7天，分选产生NP特异性IgE的B细胞并进行单细胞转录组分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。