Denis Puthier 实验室数据集(dplab R 包)

一组用于示例用途的基因组数据集子集。主题标签:免疫系统疾病、过敏性休克、基因组数据集、R 包、示例数据。本站分类:免疫系统疾病/过敏性休克

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2026-10-05 更新
浏览 17
基因组免疫系统疾病过敏性休克基因组数据集R 包示例数据
Denis Puthier's lab datasets (dplab R package)

基本信息

模态
基因组
大小
0.159550295 GB
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-05

资源简介

Denis Puthier 实验室数据集(dplab R 包)

Denis Puthier's lab datasets 是一个以 R 包形式发布的基因组数据集集合,英文名称为 dplab R package,由作者 puthier, denis 提供,发布机构为 Zenodo,发布时间为 2026 年。该数据集被归类于免疫系统疾病与过敏性休克方向,其核心定位是一组用于示例用途的基因组数据集子集。源站对其描述为“A set of genomic dataset subsets for example usage.”,即面向示例使用场景而整理的基因组数据子集。整体来看,它并非一个面向特定疾病的大规模原始数据仓库,而是以便于调用和演示为目的、围绕基因组数据组织的资源集合,主题标签涵盖免疫系统疾病、过敏性休克、基因组数据集、R 包以及示例数据,适合作为教学、方法演示或流程测试的辅助材料。

【数据集背景】

该数据集由 puthier, denis 创建,发布机构为 Zenodo,发布时间为 2026 年。其英文名称为 Denis Puthier's lab datasets,并以 dplab R 包的形式对外提供。从命名和发布形式可以看出,它来源于一个实验室的数据整理工作,目的是将基因组数据以 R 包的方式打包,方便用户在 R 环境中直接加载和使用。源站将其描述为一组用于示例用途的基因组数据集子集,说明其设计初衷并非提供完整的原始数据全集,而是抽取出的、便于演示和测试的子集。本站将其分类为免疫系统疾病 / 过敏性休克,主题标签包括免疫系统疾病、过敏性休克、基因组数据集、R 包和示例数据,表明该资源在主题上与免疫及过敏相关研究方向存在关联。

【数据内容】

根据源站描述,该数据集的内容是一组基因组数据集子集,用于示例用途。其主题标签涵盖免疫系统疾病、过敏性休克、基因组数据集、R 包以及示例数据。除上述信息外,关于具体包含哪些基因组数据类型、样本数量、物种来源、测序平台、文件格式或变量结构等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 doi.org,发布机构为 Zenodo,作者为 puthier, denis,发布时间为 2026 年。关于数据的具体采集方式、实验设计、样本来源、伦理审批信息以及原始数据的上游来源等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集以 R 包形式提供,定位为示例用途的基因组数据集子集,因此适用于需要在 R 环境中加载基因组数据子集进行演示、教学、方法测试或流程验证的场景。结合其主题标签中出现的免疫系统疾病与过敏性休克,它也可能被用于与这些方向相关的示例性分析。关于更具体的适用场景、推荐分析类型或配套教程,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 dplab R 包的形式发布,表明其预期使用方式是在 R 环境中进行加载和调用。关于具体的安装方式、依赖环境、函数接口、数据对象名称以及调用示例,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集被明确描述为用于示例用途的基因组数据集子集,这意味着其内容经过抽取和整理,而非完整的原始数据集合。关于数据质量评估指标、覆盖度、批次效应、缺失情况、版本更新记录以及已知技术限制等,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集采用 Creative Commons Attribution 4.0 International 许可,允许在署名条件下使用。作者为 puthier, denis,发布机构为 Zenodo,发布时间为 2026 年。关于具体的引用格式、DOI 编号以及署名要求的具体表述,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.23170765

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 159.6 MB。

数据说明

A set of genomic dataset subsets for example usage.

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