脂质调控的旁分泌回路协调肥大细胞成熟与过敏反应及表皮ABHD12B驱动非典型酰基神经酰胺抵御硬皮病皮肤scRNA-seq
该数据集来自omicsdi.org,包含两项研究:一是脂质调控的旁分泌回路通过肥大细胞与成纤维细胞的功能互作协调肥大细胞成熟与过敏反应;二是表皮ABHD12B驱动的非典型酰基神经酰胺抵御硬皮病,并提供皮肤单细胞RNA测序数据
![1) Lipid-orchestrated paracrine circuit coordinates mast cell maturation and anaphylaxis through functional interaction with fibroblasts & 2) Epidermal ABHD12B-driven atypical acylceramide safeguards against scleroderma [skin scRNA-seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/97671.jpg)
基本信息
资源简介
脂质调控的旁分泌回路协调肥大细胞成熟与过敏反应及表皮ABHD12B驱动非典型酰基神经酰胺抵御硬皮病皮肤scRNA-seq
该数据集收录于omicsdi.org,主题标签为Genomics,本站分类归入免疫系统疾病与过敏性休克方向。数据集围绕两项紧密关联的研究展开:第一项研究关注脂质调控的旁分泌回路,揭示其通过肥大细胞与成纤维细胞之间的功能互作,协调肥大细胞成熟与过敏反应过程;第二项研究聚焦表皮中ABHD12B驱动的非典型酰基神经酰胺,探讨其在抵御硬皮病方面的作用。两项研究共同提供了皮肤单细胞RNA测序数据,为在单细胞分辨率下理解皮肤免疫微环境、脂质代谢与免疫细胞成熟之间的关联提供了数据基础。整体而言,该数据集将脂质信号、细胞间通讯与皮肤免疫病理机制联系起来,适合用于免疫系统疾病特别是过敏性休克相关机制的研究。
【数据集背景】
该数据集所对应的研究背景涉及免疫系统疾病与过敏性休克领域。第一项研究的问题指向肥大细胞成熟与过敏反应如何受到脂质调控的旁分泌回路影响,并强调肥大细胞与成纤维细胞之间的功能互作在其中扮演的角色。第二项研究则关注硬皮病这一皮肤相关疾病,提出表皮ABHD12B驱动的非典型酰基神经酰胺具有抵御硬皮病的作用。两项研究均以皮肤为组织背景,并借助单细胞RNA测序技术获取数据,因此该数据集在主题上同时覆盖免疫细胞成熟、过敏反应、脂质代谢与皮肤纤维化相关疾病等方向。
【数据内容】
该数据集包含两项研究对应的皮肤单细胞RNA测序数据。第一项研究的数据内容围绕脂质调控的旁分泌回路展开,涉及肥大细胞与成纤维细胞之间的功能互作,以及该互作对肥大细胞成熟和过敏反应的协调作用。第二项研究的数据内容围绕表皮ABHD12B驱动的非典型酰基神经酰胺展开,涉及该类脂质对硬皮病的抵御作用。数据集的主题标签为Genomics,表明其数据属性属于基因组学范畴。除上述信息外,源站未提供更细化的数据内容说明。
【采集与来源】
该数据集来源于omicsdi.org。其英文名称由两项研究的标题组成,分别对应脂质调控旁分泌回路协调肥大细胞成熟与过敏反应的研究,以及表皮ABHD12B驱动的非典型酰基神经酰胺抵御硬皮病的研究,并明确标注为皮肤单细胞RNA测序数据。本站分类将其归入免疫系统疾病与过敏性休克。除来源站为omicsdi.org以及上述标题信息外,源站未提供关于样本采集地点、采集时间、受试者信息或实验平台等更详细的采集信息。
【适用场景】
该数据集适用于免疫系统疾病与过敏性休克相关的研究场景,尤其是需要在单细胞水平考察皮肤组织中肥大细胞与成纤维细胞互作的场景。第一项研究对应的数据可用于探索脂质调控的旁分泌回路如何影响肥大细胞成熟与过敏反应。第二项研究对应的数据可用于探索表皮ABHD12B驱动的非典型酰基神经酰胺与硬皮病抵御机制之间的关系。此外,由于主题标签为Genomics,该数据集也可用于基因组学范畴内与皮肤单细胞转录组相关的分析。除上述方向外,源站未提供其他具体适用场景。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据下载方式、文件格式、分析流程、预处理步骤或推荐工具等信息。
【质量与限制】
源站未提供该数据集的质量评估信息与使用限制说明,包括数据完整性、批次效应、测序深度、细胞数量或潜在偏倚等内容。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。
下载信息
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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数据集获取
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
- Lipid-orchestrated paracrine circuit coordinates mast cell maturation and anaphylaxis through functional interaction with fibroblasts & 2) Epidermal ABHD12B-driven atypical acylceramide safeguards against scleroderma [skin scRNA-seq]
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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