人脐血CD34+细胞中ZMYM2/FGFR1、BCR/FGFR1或BCR/ABL1的基因表达谱比较
该数据集来自ebi.ac.uk,属于血液与淋巴系统疾病/骨髓增殖性疾病分类,采用转录组芯片技术分析人脐血CD34+细胞中表达ZMYM2/FGFR1、BCR/FGFR1或BCR/ABL1融合癌基因后的全局基因表达谱

基本信息
资源简介
人脐血CD34+细胞中ZMYM2/FGFR1、BCR/FGFR1或BCR/ABL1的基因表达谱比较
ZMYM2/FGFR1, BCR/FGFR1 or BCR/ABL1 in human cord blood CD34+ cells reveals similar but distinct gene expression profiles
该数据集来自ebi.ac.uk,属于血液与淋巴系统疾病/骨髓增殖性疾病分类,采用转录组芯片技术分析人脐血CD34+细胞中表达ZMYM2/FGFR1、BCR/FGFR1或BCR/ABL1融合癌基因后的全局基因表达谱。数据可用于比较三种融合癌基因引起的转录程序异同,研究8p11骨髓增殖综合征及慢性髓系白血病相关分子机制(来源 BioStudies)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):8p11骨髓增殖综合征(EMS),也称为干细胞白血病/淋巴瘤综合征,是一种慢性骨髓增殖性疾病,会迅速进展为急性白血病。在分子水平上,EMS的特征是各种伙伴基因与FGFR1基因融合,导致FGFR1内酪氨酸激酶活性组成性激活。人类EMS中最常见的两种融合基因是ZMYM2/FGFR1(以前称为ZNF198/FGFR1)和BCR/FGFR1。为了研究FGFR1融合基因导致的转录程序失调,对表达融合癌基因ZMYM2/FGFR1和BCR/FGFR1中任一种的人CD34+脐血细胞进行了全局基因表达分析。作为参考基因,我们还纳入了与慢性髓系白血病相关的、研究较多的BCR/ABL1融合癌基因。我们发现,3种不同的融合癌基因共同具有上调
【主题与分类】
主题标签:transcription profiling by array、Homo sapiens。本站分类:血液与淋巴系统疾病/骨髓增殖性疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-15811
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- OpenDataLab:
数据说明
Carin Lassen; David Gisselsson; Marcus Jaras; Thoas Fioretos; Anna Andersson; Helena Agerstam; Mats Ehinger; Petra Johnels; Xiaolong Fan; Johan Richter; Tor Olofsson (2010). ZMYM2/FGFR1, BCR/FGFR1 or BCR/ABL1 in human cord blood CD34+ cells reveals similar but distinct gene expression profiles [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-15811
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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