低危骨髓增生异常综合征的甲基化谱
该数据集来自ebi.ac.uk,为低危骨髓增生异常综合征(MDS)的甲基化谱数据,采用高密度微阵列测量基因表达与甲基化状态

基本信息
资源简介
低危骨髓增生异常综合征的甲基化谱
Methylation profiling of Low-Risk Myelodysplastic Syndromes (MDSs)
该数据集来自ebi.ac.uk,为低危骨髓增生异常综合征(MDS)的甲基化谱数据,采用高密度微阵列测量基因表达与甲基化状态。数据覆盖低危MDS与健康对照的全基因组表观遗传调控标记及基因表达水平,共鉴定出552个差异甲基化CpG位点,其中高甲基化基因多于低甲基化基因,表达谱还发现1005个显著差异基因。该数据可用于研究MDS与健康对照的生物学差异、筛选异常高甲基化且表达降低的靶点,并辅助MDS亚型分类(来源 BioStudies)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):全基因组表达和甲基化谱分析识别出低危骨髓增生异常综合征(MDS)中具有异常高甲基化和表达降低的新靶点。基因表达谱特征可用于对骨髓增生异常综合征(MDS)患者的亚型进行分类。然而,关于MDS整体甲基化状态的报道很少。将全基因组表观遗传调控标记与基因表达水平整合,可提供关于MDS与健康对照之间生物学差异的额外信息。基因表达和甲基化状态使用高密度微阵列测量。在低危MDS中总共鉴定出552个差异甲基化CpG位点;高甲基化基因比低甲基化基因更常见。此外,mRNA表达谱分析鉴定出1005个显著差异的基因
【主题与分类】
主题标签:methylation profiling by array、Homo sapiens。本站分类:血液与淋巴系统疾病/骨髓增生异常综合征。
【获取与许可】
源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-41215
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- OpenDataLab:
数据说明
Javier De Las Rivas; Monica Del Rey; Kathleen OM-bM-^@M-^YHagan; Margaret Dellett; Sara Aibar; Hilary Colyer; MariaEugenia Alonso; Maria Diez-Campelo; Richard Armstrong; Daniel Sharpe; Norma Gutierrez; JuanLuis GarcM-CM–a; Javier DeLasRivas; Ken Mills; Jesus HernM-CM-!ndez-Rivas (2012). Methylation profiling of Low-Risk Myelodysplastic Syndromes (MDSs) [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-41215
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