Affymetrix SNP array data for myelodysplastic syndrome with 5q deletion treated with lenalidomide
包含来那度胺治疗的5q缺失MDS患者的Affymetrix SNP阵列数据，评估核型复杂性、血小板计数和TP53突变对治疗反应的影响。
基本信息
资源简介
Affymetrix SNP array data for myelodysplastic syndrome with 5q deletion treated with lenalidomide
【一句话概览】
本数据集是 NCBI 公开的组学数据集，收录 1 个文件，主题涵盖 Genome variation profiling by SNP array、GPL3718、9606，可用于生物标志物发现与分子分型研究。
【数据集背景】
源站首次发布：Feb 09 201。
【数据内容】
源站原始描述：Lenalidome is a drug especially effective in low risk myelodysplastic syndromes (MDS) with isolated 5q deletion. However, 25% of the patients did not respond. TP53 mutations have been described to play a role in the disease progression, and karyotypic complexity also has an important impact in the outcome. We selected 53 MDS patients with 5q deletion and treated with lenalidomide and we studied by the following techniques: conventional G-banding cytogenetics (CC), single nucleotide polymorphism…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Genome variation profiling by SNP array、GPL3718、9606。
【适用方向】
组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE35656
【使用注意】
· 源站最后修改于 Nov 27 201，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE35656
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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