淋巴瘤_PDX模型_变异基因与CNV基因列表数据
该数据集包含淋巴瘤(DLBCL、MCL、T-NHL、BL四种亚型)的基因变异位点列表和拷贝数变异(CNV)基因列表,数据模态为基因变异与CNV的表格数据,同时提供了PDX模型与患者样本的共有点位以及PDX衍生过程中的位点变化信息,主要用于淋巴瘤的基因突变研究、拷贝数变异分析以及PDX模型在肿瘤生物学和药物研发中的应用探索。
基本信息
资源简介
该数据集是一个淋巴瘤相关的基因变异与拷贝数变异(CNV)研究数据集,主要包含经过过滤的变异位点及基因列表,涵盖弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、套细胞淋巴瘤(MCL)、T细胞非霍奇金淋巴瘤(T-NHL)和伯基特淋巴瘤(BL)四种亚型。数据集中提供了患者来源异种移植(PDX)模型样本与对应患者样本之间的共有点位、PDX模型在衍生过程中获得或丢失的位点,以及预组装的CNV基因列表。这些数据来源于公开的淋巴瘤研究,可用于分析淋巴瘤的基因突变模式、拷贝数变异特征,以及PDX模型在模拟肿瘤进化与药物反应研究中的应用。
下载信息
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需登录公开下载
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暂未开放有偿下载
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使用方式
数据集获取
源站:https://haidatas.com/dataset/linbaliu_pdxmoxing_bianyijiyinyucnvjiyinli_e8e4e853
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个淋巴瘤相关的基因变异与拷贝数变异(CNV)研究数据集,主要包含经过过滤的变异位点及基因列表,涵盖弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、套细胞淋巴瘤(MCL)、T细胞非霍奇金淋巴瘤(T-NHL)和伯基特淋巴瘤(BL)四种亚型。数据集中提供了患者来源异种移植(PDX)模型样本与对应患者样本之间的共有点位、PDX模型在衍生过程中获得或丢失的位点,以及预组装的CNV基因列表。这些数据来源于公开的淋巴瘤研究,可用于分析淋巴瘤的基因突变模式、拷贝数变异特征,以及PDX模型在模拟肿瘤进化与药物反应研究中的应用。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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