Waldenström巨球蛋白血症的甲基化谱分析
该数据集整合了34名受试者的DNA甲基化、RNA测序和全外显子组测序等多组学数据，聚焦于Waldenström巨球蛋白血症和IgM意义未明的单克隆丙种球蛋白病，通过分析差异甲基化区域及表观遗传调控通路，旨在揭示DNA甲基化在IgM单克隆丙种球蛋白病肿瘤发生和细胞功能中的关键作用，为相关疾病的机制研究和潜在治疗靶点探索提供数据支持。
基本信息
资源简介
该数据集是一个多组学前瞻性研究数据集，旨在探究DNA甲基化在IgM单克隆丙种球蛋白病（包括Waldenström巨球蛋白血症和IgM意义未明的单克隆丙种球蛋白病）中的作用。数据集整合了34名受试者（23例WM患者、6例IgM-MGUS患者和5例正常对照）的DNA甲基化、RNA测序和全外显子组测序数据。通过全基因组DNA甲基化分析，识别了不同组别间的差异甲基化区域，并依据基因组区域进行注释。进一步结合RNA-seq数据，揭示了与细胞周期、代谢、细胞因子/免疫信号、细胞骨架、肿瘤微环境和细胞内信号传导相关的潜在表观遗传调控通路。研究发现，与IgM-MGUS相比，WM中CXCR4信号通路及多种白细胞介素信号通路（如IL-6、IL-8、IL-15）呈正富集。此外，对已知抑癌基因和癌基因的评估显示，包括CCND1和CD79B在内的多个靶标存在启动子甲基化差异及相应的基因表达变化。该数据集为理解IgM丙种球蛋白病中异常DNA甲基化在肿瘤发生和关键细胞功能的表观遗传调控中的作用提供了重要资源。
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源站：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.11206553
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数据说明
该数据集是一个多组学前瞻性研究数据集，旨在探究DNA甲基化在IgM单克隆丙种球蛋白病（包括Waldenström巨球蛋白血症和IgM意义未明的单克隆丙种球蛋白病）中的作用。数据集整合了34名受试者（23例WM患者、6例IgM-MGUS患者和5例正常对照）的DNA甲基化、RNA测序和全外显子组测序数据。通过全基因组DNA甲基化分析，识别了不同组别间的差异甲基化区域，并依据基因组区域进行注释。进一步结合RNA-seq数据，揭示了与细胞周期、代谢、细胞因子/免疫信号、细胞骨架、肿瘤微环境和细胞内信号传导相关的潜在表观遗传调控通路。研究发现，与IgM-MGUS相比，WM中CXCR4信号通路及多种白细胞介素信号通路（如IL-6、IL-8、IL-15）呈正富集。此外，对已知抑癌基因和癌基因的评估显示，包括CCND1和CD79B在内的多个靶标存在启动子甲基化差异及相应的基因表达变化。该数据集为理解IgM丙种球蛋白病中异常DNA甲基化在肿瘤发生和关键细胞功能的表观遗传调控中的作用提供了重要资源。
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