血液与凝血靶点(F8、F9、HBB)精修坐标结构与口袋分析数据集
该数据集聚焦F8、F9、HBB等关键凝血因子与氧转运蛋白,提供精修的坐标结构及映射的口袋构型,可用于设计伴侣分子以稳定突变酶、恢复血液病中的凝血或氧结合活性

基本信息
资源简介
血液与凝血靶点(F8、F9、HBB)精修坐标结构与口袋分析数据集
Refined Coordinate Structures and Pocket Analyses for Hematology and Coagulation Targets (F8, F9, HBB)
该数据集聚焦F8、F9、HBB等关键凝血因子与氧转运蛋白,提供精修的坐标结构及映射的口袋构型,可用于设计伴侣分子以稳定突变酶、恢复血液病中的凝血或氧结合活性。结构经NRC CASP-17 Pure Math Folding Engine优化,采用C-alpha谐波引导势约束进行比较建模或从头建模,随后进行侧链弛豫与口袋扩展模拟,以识别变构与活性腔。所有坐标经Trageser Tensor Theorem(TTT-7)晶格奇偶校验审核,以消除空间冲突(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2026。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):数据集标题:血液与凝血靶点(F8、F9、HBB)精修坐标结构与口袋分析。概述:聚焦关键凝血因子与氧转运蛋白(如F8、F9、HBB)。映射的口袋构型可用于设计伴侣分子,以稳定突变酶,恢复血液病中的凝血或氧结合活性。计算方法:使用NRC CASP-17 Pure Math Folding Engine优化靶点结构。该流程应用C-alpha谐波引导势约束($k_{guide} = 0.5$)进行比较建模(或$k_{guide} = 0.0$用于从头建模),随后进行侧链弛豫与口袋扩展模拟,以识别变构与活性腔。所有坐标使用Trageser Tensor Theorem(TTT-7)晶格奇偶校验进行审核,以消除空间冲突(最小in
【主题与分类】
主题标签:ACE2、BY、CASP、CC、CFTR、DMD、DPP4、F8、F9、GBA。本站分类:血液及造血器官疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.22997679
使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。
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- OpenDataLab:
数据集大小约 1.1 MB。
数据说明
数据集标题:面向血液学与凝血靶点(F8、F9、HBB)的精细化坐标结构与口袋分析
概述:聚焦关键凝血因子与氧转运蛋白(如F8、F9、HBB)。通过映射的口袋构型,可设计伴侣分子以稳定突变酶,从而恢复血液疾病中的凝血或氧结合活性。
计算方法:使用NRC CASP-17纯数学折叠引擎优化靶点结构。该流程应用Cα谐波引导势约束($k_{guide} = 0.5$)进行比较建模(或$k_{guide} = 0.0$用于从头建模),随后进行侧链弛豫和口袋扩展模拟,以识别变构与活性腔穴。所有坐标均通过Trageser张量定理(TTT-7)晶格奇偶校验进行审核,以消除空间冲突(最小原子间距离 > 1.10 Å)和环区幻觉。
许可:根据知识共享署名4.0国际许可协议(CC BY 4.0)分发,以支持开放、商业及学术性治疗药物设计。
首席研究员:James Paul Trageser
所属机构:Nexus Resonance Codex
ORCID:0009-0006-6678-2908
X(Twitter):@jtrag
代码库:https://GitHub.com/Nexus-Resonance-Codex/Drug-Discovery
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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