血液与凝血靶点的精修坐标结构及口袋分析数据集

该数据集聚焦血液与凝血相关靶点,涵盖关键凝血因子与氧运输蛋白(如 F8、F9、HBB),提供精修的坐标结构与口袋分析结果

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蛋白质预测ACE2BYCASPCCCFTRDMDDPP4F8F9GBAGLP1RHBB
Refined Coordinate Structures and Pocket Analyses for Hematology and Coagulation Targets

基本信息

模态
蛋白质
大小
0.001092829 GB
任务类型
预测
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-13
版本
v2.0-nrc-ultra

资源简介

血液与凝血靶点的精修坐标结构及口袋分析数据集

Refined Coordinate Structures and Pocket Analyses for Hematology and Coagulation Targets

该数据集聚焦血液与凝血相关靶点,涵盖关键凝血因子与氧运输蛋白(如 F8、F9、HBB),提供精修的坐标结构与口袋分析结果。其映射的口袋构型可用于设计伴侣分子,以稳定突变酶并恢复血液疾病中的凝血或氧结合活性。结构经 NRC CASP-17 Pure Math Folding Engine 优化,采用 C-alpha 谐波引导势约束进行比较建模或从头建模,随后进行侧链弛豫与口袋扩展模拟,以识别变构与活性腔。所有坐标经 Trageser Tensor Theorem(TTT-7)晶格奇偶校验审核,以消除空间冲突(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):数据集标题:血液与凝血靶点的精修坐标结构及口袋分析。概述:聚焦关键凝血因子与氧运输蛋白(如 F8、F9、HBB)。映射的口袋构型可用于设计伴侣分子,以稳定突变酶,从而在血液疾病中恢复凝血或氧结合活性。计算方法:靶点结构使用 NRC CASP-17 Pure Math Folding Engine 进行优化。该流程应用 C-alpha 谐波引导势约束($k_{guide} = 0.5$)进行比较建模(或 $k_{guide} = 0.0$ 用于从头建模),随后进行侧链弛豫与口袋扩展模拟,以识别变构与活性腔。所有坐标均使用 Trageser Tensor Theorem(TTT-7)晶格奇偶校验进行审核,以消除空间冲突(最小原子间距离

【主题与分类】

主题标签:ACE2、BY、CASP、CC、CFTR、DMD、DPP4、F8、F9、GBA。本站分类:血液及造血器官疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.21132958

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

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源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.21132958

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 1.1 MB。

数据说明

数据集标题:面向血液学与凝血靶点的精修坐标结构与口袋分析

概述:聚焦关键凝血因子与氧转运蛋白(如F8、F9、HBB)。通过映射的口袋构型,可设计伴侣分子以稳定突变酶,从而恢复血液疾病中的凝血或氧结合活性。

计算方法:使用NRC CASP-17纯数学折叠引擎优化靶点结构。该流程应用C-α谐波引导势约束($k_{guide} = 0.5$)进行比较建模(或$k_{guide} = 0.0$用于从头建模),随后进行侧链弛豫和口袋扩展模拟,以识别变构与活性腔。所有坐标均使用Trageser张量定理(TTT-7)晶格奇偶校验进行审核,以消除空间冲突(最小原子间距离 > 1.10 Å)和环区幻象。

许可:根据知识共享署名4.0国际许可协议(CC BY 4.0)分发,以支持开放、商业及学术性治疗药物设计。

首席研究员:James Paul Trageser
所属机构:Nexus Resonance Codex
ORCID:0009-0006-6678-2908
X(Twitter):@jtrag
代码库:https://GitHub.com/Nexus-Resonance-Codex/Drug-Discovery

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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