鸡传染性贫血病毒通过抑制CD40L表达损害疫苗诱导的抗体反应
该数据集来自 NCBI BioProject(ID 1420973),主题为鸡传染性贫血病毒通过抑制 CD40L 表达损害疫苗诱导的抗体反应,数据主题标签为 Raw sequence reads

基本信息
资源简介
鸡传染性贫血病毒通过抑制CD40L表达损害疫苗诱导的抗体反应
PRJNA1420973 是 NCBI BioProject 数据库中的一项生物项目记录,其研究主题为鸡传染性贫血病毒通过抑制 CD40L 表达损害疫苗诱导的抗体反应。该数据集在站内被归类于血液及造血器官疾病 / 其他类别,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,主题标签为 Raw sequence reads。整体而言,该项目围绕鸡传染性贫血病毒与宿主免疫应答之间的相互作用展开,重点关注病毒如何通过影响 CD40L 的表达进而削弱疫苗接种所诱导的抗体反应,相关数据以原始测序读段的形式组织与呈现,为研究者提供了一个可检索、可关联的项目入口。
【数据集背景】
该数据集来自 NCBI BioProject,项目编号为 1420973。BioProject 是 NCBI 中用于汇集与某一单一研究计划相关的生物学数据的记录类型,这些数据通常源自单一组织或联合体。BioProject 记录为用户提供一个统一的位置,以便查找该项目所产生的多种数据类型之间的链接。本站将该数据集归类为血液及造血器官疾病 / 其他,主题标签为 Raw sequence reads。从标题可知,该项目的科学背景涉及鸡传染性贫血病毒对疫苗诱导抗体反应的损害作用,并聚焦于 CD40L 表达受抑制这一机制线索。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Raw sequence reads,表明其数据内容以原始序列读段为主。项目标题明确指出研究内容为鸡传染性贫血病毒通过抑制 CD40L 表达损害疫苗诱导的抗体反应。除上述信息外,关于具体样本数量、测序平台、读段长度、数据量、文件格式等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“ID 1420973 - BioProject - NCBI”。BioProject 记录本身是对某一研究计划相关生物学数据的汇集,这些数据可来自单一组织或联合体。关于样本采集地点、采集时间、实验动物品系、免疫程序、病毒株信息等具体采集背景,源站未提供。
【适用场景】
基于项目标题与主题标签,该数据集适用于与鸡传染性贫血病毒、疫苗诱导抗体反应、CD40L 表达调控以及相关转录组或序列分析有关的研究场景。由于数据主题标签为 Raw sequence reads,其可能用于序列比对、表达分析或免疫相关通路的探索。但关于该数据集具体支持的分析类型、可回答的科学问题范围,源站未提供。
【使用方法】
该数据集为 NCBI BioProject 记录,用户可通过 BioProject 编号 1420973 在 NCBI 中定位该项目,并借助 BioProject 记录所提供的链接查找该项目产生的多种数据类型。关于原始序列读段的具体下载方式、数据处理流程、分析工具与参数设置,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集以 BioProject 形式组织,提供项目层面的入口与数据链接。关于数据质量评估指标、测序深度、覆盖度、重复性、批次效应、样本排除标准等质量控制信息,源站未提供。此外,该数据集在站内被归类为血液及造血器官疾病 / 其他,但该分类与具体数据质量之间的关系,源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可条款、使用限制或数据共享政策,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1420973
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为探究鸡传染性贫血病毒(CIAV)所致免疫抑制的分子机制,从CIAV感染鸡和未感染对照鸡中分离脾淋巴细胞。为模拟免疫激活,用鸡CD3和CD28单克隆抗体(anti-chCD3和anti-chCD28)刺激细胞6 h,同时设置未刺激对照组。从各样本中提取总RNA,随后进行文库构建。在Illumina NovaSeq平台上进行测序以生成RNA-seq数据。该数据集用于鉴定差异表达基因(DEGs),并分析与免疫应答和抗病毒防御相关的通路。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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