Angus与Holstein小母牛生育力病例对照设计的转录本丰度数据集
该数据集来自NCBI GEO，包含22头小母牛（纯种Angus n=12，纯种Holstein n=10）外周白细胞的转录组数据，采用病例对照设计比较Fertile与Sub-Fertile两组
基本信息
资源简介
Angus与Holstein小母牛生育力病例对照设计的转录本丰度数据集
Transcript abundances associated with fertility in a case-control design including Angus and Holstein heifers
该数据集来自NCBI GEO，包含22头小母牛（纯种Angus n=12，纯种Holstein n=10）外周白细胞的转录组数据，采用病例对照设计比较Fertile与Sub-Fertile两组。研究发现APMAP在Fertile组丰度高1.16倍，DNAI7在Sub-Fertile组丰度高1.23倍（eFDR≤0.002）。数据可用于探索不同品种间生育力相关的基因表达差异，支持分类或差异表达分析（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Dec 06 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：我们开展了一项实验，以检验以下假设：由于生育适应度导致的基因转录本丰度差异将在不同品种的小母牛之间共享。我们从22头小母牛（纯种Angus小母牛（n=12）、纯种Holstein小母牛（n=10））的外周白细胞中产生了转录组数据。我们鉴定出两个基因，其转录本丰度在两组（Fertile和Sub-Fertile）之间不同（eFDR ≤ 0.002），即Adipocyte Plasma Membrane Associated Protein（APMAP，在Fertile组中丰度高1.16倍）和Dynein Axonemal Intermediate Chain 7（DNAI7，在Sub-Fertile组中丰度高1.23倍）。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL26012、9913。本站分类：血液及造血器官疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE220220
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jun 17 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
我们进行了一项实验，以检验以下假设：由于生育适应度导致的基因转录本丰度差异会在不同品种的小母牛之间共享。我们从22头小母牛（纯种安格斯小母牛（n=12）、纯种荷斯坦小母牛（n=10））的外周白细胞中产生了转录组数据。我们鉴定出两个基因，其转录本丰度在两组（高生育力组和低生育力组）之间存在差异（eFDR ≤ 0.002），即脂肪细胞质膜相关蛋白（APMAP，在高生育力组中丰度高1.16倍）和动力蛋白轴丝中间链7（DNAI7，在低生育力组中丰度高1.23倍）。
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